Der Lenkungsausschuss des CIN hat eine externe Aufsicht durch die Einrichtung eines externen wissenschaftlichen Beirats eingerichtet, der vom Rektor der Universität ernannt wird. Der Beirat besteht aus international renommierten Wissenschaftler*innen mit Expertise im einen oder anderen Forschungsbereich des CIN. Der Beirat kommt einmal im Jahr in Tübingen zusammen, begleitet und bewertet die wissenschaftliche und strukturelle Entwicklung des CIN und berichtet dem Rektor nach dem jährlichen Treffen.