Department of Computer Science

Themen für Bachelor- und Masterarbeiten
in unserer Gruppe

Wir bieten im Umfeld unserer laufenden Forschungs- und Kooperationsprojekte für interessierte Studentinnen und Studenten der Bioinformatik, Informatik und Medieninformatik spannende Themen für Bachelor- und Masterarbeiten an.
Wir laden dazu Studentinnen und Studenten gerne ein, sich neben den offenen auf dieser Webseite veröffentlichen Themen auch direkt an uns mit Themenwünschen zu wenden. Entsprechend den Interessen des Studierenden kann so auch ein Thema direkt gestaltet werden.
In unserer Gruppe werden Sie direkt von einem Mitarbeiter und der Gruppenleiterin eng betreut und haben auch für die Dauer der Arbeit einen Arbeitsplatz in der Gruppe. So profitieren Sie nicht nur von einer regen Diskussionskultur, sondern erleben auch jeden Tag, wie moderne Bioinformatikforschung gelebt wird.

Laufende studentische Arbeiten

Laufende Masterarbeiten

Thema BetreuerIn BearbeiterIn
How bitter is Lactococcus lactus? An integrative genomic approach to identify genes of bitterness Kay Nieselt / Prof. Herbert Schmidt (Uni Hohenheim) Robert Harmening
Identification and characterization of small RNA transcripts from differential RNA-seq data Kay Nieselt Dilek Dere

Laufende Bachelorarbeiten

Thema BetreuerIn BearbeiterIn

Differential gene expression in different healthy human brain regions using CAGE-seq data

Kay Nieselt /

André Hennig

An Jiahui

Data mining for conditions which influence the echolocation behavior of forgaging Rhinopoma microphyllum

Kay Nieselt / Prof. Schnitzler Mark Krause
Detektion differentiell exprimierter Gene in Zeitreihendaten am Beispiel Streptomyces coelicolor Kay Nieselt Hannah Frank
Gene regulatory networks from time series expression data in Streptomyces coelicolor Kay Nieselt Marvin Döbel
Eine vergleichende Studie von Microarray- und RNASeq-Daten Kay Nieselt Nadine Schacherer

Offene studentische Arbeiten

Offene Masterarbeiten

Offene Bachelorarbeiten

Derzeit gibt es zu den folgenden globalen Themen die Möglichkeit eine Bachelorarbeit zu schreiben (genaue Themenausführung nach Nachfrage, weitere Themen auch auf Nachfrage):

Thema BetreuerIn
Ancient DNA: Algorithmen und Anwendungen  
Transkriptomik: Algorithmen und Anwendungen  
Visualisierung biologischer Daten: Algorithmen und Anwendungen  

Abgeschlossene studentische Arbeiten

Abgeschlossene Masterarbeiten

Thema BetreuerIn BearbeiterIn Be-endet
Genome architecture-aware mapping using the SuperGenome

K. Nieselt

N. Ziemert

Friederike Hanssen März 2019
Visualization approaches for tumor evolution in liquid biopsy data

N. Gehlenborg (extern, Harvard Medical)

K. Nieselt

Theresa Harbig Sept. 2018
Representation of ME-models in SBML

O. Kohlbacher

K. Nieselt

Marc Alexander Voigt Mai 2018
Single Cell RNA-seq for Plant Protoplasts

M. Timmermans

K. Nieselt

Chong Lu

Juli

2018

Application of NGS to the identification of antibiotic resistant bacteria

Prof. K. Musser (Wadsworth Center, Albany, USA)

K. Nieselt

Wolfgang Haas Feb. 2018
Large-scale Pangenomics

M. Pop, UMD (extern)

K. Nieselt

Nils Oliver Schliebs Jan. 2018
Integrative characterization of the house dust mite murine asthma model

K. Nieselt

Boehringer (extern)

Kevin Menden Okt. 2017
Studying Parasite-Host interaction

K. Nieselt

T. Dijkstra

Fabian Mörtter Okt. 2017
Phylogenetic reconstruction of genomes from ancient DNA and modern DNA

K. Nieselt

Prof. Fischer (Greifswald)

Veronika Böttcher

Juli

2017

Methods for time-series differential gene expression analysis

K. Nieselt

R. Neher

Adrian Geißler Nov. 2016
Metabarcoding workflows for Biodiversity assessment of belowground fungal communities

K. Nieselt

N. Ziemert

Max Emil Schön Juni 2016
TSSpredator 2.0: Improved and enhanced transcription start site prediction

K. Nieselt

A. Herbig

(J. Krause)

Sven Fillinger Juni 2016
Evaluation and Extension of PASSAGE – Parallel Sequencing Systems for the Analysis of Gene Expression

K. Nieselt

H. Köhler

Lucia Vedder Juni 2016
Testing framework and improved algorithms for ancient genome reconstruction

K. Nieselt

J. Krause

Judith Neukamm Dez. 2015
StreptoExpress – genomewide expression analyses of Streptomyces coelicolor K. Nieselt Natalya Sabirova Sept. 2014
From the SuperGenome to the Pangenome of Bacteria

K. Nieselt

F. Götz

André Hennig April 2014
Bioprocess Data Modelling of Chinese Hamster Ovary Cells

K. Nieselt

O. Kohlbacher

Julia Söllner Sept. 2013
Efficient algorithms for Ancient Human Genome Reconstruction

K. Nieselt

J. Krause

Alexander Peltzer Nov. 2013
The SuperGenome of Staphylococcus aureus

A. Herbig

K. Nieselt

Linus Backert Aug. 2013
Algorithms for the assembly of ancient genomes

K. Nieselt

J. Krause

Volodymyr Piven

Juli

2013

A new very fast mapping algorithm based on sorting

K. Nieselt

A. Herbig

Jörg Peter April 2013
Prediction and Systematic Comparison of Non-Coding RNAs in the Bacteria Kingdom

A. Herbig

K. Nieselt

Andreas Friedrich Nov. 2012
The history and evolution of SNPs in Yersinia pestis

K. Nieselt

J. Krause

Philip Stevens Sept. 2012
Statistics with confidence in comparative metagenomics

K. Nieselt

D. Huson

Max Schubach April 2012
Metagenomic Pathway Analysis

K. Nieselt

D. Huson

Tim Scheurenbrand Jan. 2012
A dynamic model of metabolism in Enterococcus faecalis

K. Nieselt

Prof. P. Wills

(NZ)

Markus List

Mai

2011

3D-Visualization Analytics for Transcriptomic Data

K. Niedrlz

Prof. G. Scheuermann

Günter Jäger Nov. 2010
Automated Extraction of Variation Mentionas from Literature Sources and Mapping to a unique Database Identifier

K. Nieselt

Prof. P. M. Hofmann-Apitius

Philippe Thomas

Juli

2008

Predition of tissue specific enhancers in Caenorhabditis elegans

K. Nieselt

R. Sommer

C. Dieterich

Philipp Drewe Nov. 2007

Abgeschlossene Bachelorarbeiten

Thema BetreuerIn BearbeiterIn Be-endet
Indexing the SuperGenome

A. Hennig

K. Nieselt

Mauro Di Girolamo

März

2019

Comparison of microarray and RNA-seq derived transcriptomes in Streptomyces coelicolor K. Nieselt Kilian Bunge

Feb.

2019

EVIDENTE – A Visual Analytics Tool for Data Enrichment in Phylogenetic Trees

A. Seitz

K. Nieselt

Mathias Alexander Witte Paz

Aug.

2018

Effiziente Identifikation von Claden-spezifischen SNPs

A. Seitz

K. Nieselt

Katrin Fischer

Mai

2018

Erstellung eines Web User Interface für die Vorhersage von Transkriptionsstartpunkten aus dRNA-seq-Daten

S. Fillinger

K. Nieselt

Julian Müller

Feb.

2018

Implementierung eines Tools zur Maskierung repetitiver Sequenzen in Genomen

A. Seitz

K. Nieselt

Friederike Hanssen

Feb.

2017

Genomic haplotype phasing and motif searching around recomination hotspots in stickleback fish

F. Jones

K. Nieselt

Marcus Lahm

Jan.

2017

Evaluierungstoolbox zur Assemblierung kurzer Sequenzfragmente altertümlicher, metagenomischer Proben

A. Seitz

K. Nieselt

Lars-Christian Achauer

Aug.

2016

Funktions- und strukturbasierte Analyse genetischer Varianten mit Fokus auf klinische Phänotypen

A. Seitz

F. Battke

Tobias Koch

Feb.

2016

Funktionale Annotation von genetischen Varianten mit Fokus auf klinische Phänotypen

A. Seitz

F. Battke

Jonas Kübler

Feb.

2016

PanGeeDB: A SuperGenome-based database for Pan-genomes

A. Hennig

K. Nieselt

Marie Gauder

Dez.

2015

Genexpressionsstudien in Streptomyces coelicolor mit Hilfe von Mayday

A. Hennig

K. Nieselt

Alexander Stoppel

Mai

2015

Implementierung einer Toolbox zur automatisierten Reportgenerierung innerhalb der EAGER Pipeline

K. Nieselt

A. Peltzer

Maximilian Hanussek

Aug.

2014

Toolbox zur Erstellung von Contamination Reports innerhalb der EAGER Pipeline

K. Nieselt

A. Peltzer

Christopher Jürges

April

2014

The expression landscape of monozygotic twins K. Nieselt Alicia Owen

Aug.

2014

Collact.me Android App Development A. C. Polatkan Nicolai Wahn

Aug.

2014

Tweet content mining and visualization of user reputation scores for Collact.me framework A. C. Polatkan Philipp Weber

April

2014

TOPAS – Toolkit for Processing and Annotating Sequence Data K.Nieselt Simon Heumos

April

2014

Bigramm-Alignierung und ihre Anwendung in der historischen Linguistik

L. Steiner

C.Höner zu Siederdissen

K. Nieselt

Nancy Retzlaff

Aug.

2013

Interaktives visuelles Clustering G. Jäger Eugen Netz

Aug.

2013

Design and implementation of administration and enrichment tools for the Collaborative Social Network: Collact A. C. Polatkan Martin Lang

Aug.

2013

Mikrogravitationsabhänige Genexpression in Arabidopsis thaliana

K.Nieselt

G. Jäger

Ina Spirer

Aug.

2013

Parallelisierung des QT-Clusterings in Mayday

G. Jäger

K. Nieselt

Sebastian Nagel

Aug.

2012

Design und Implementierung einer REST-API für ein Soziales Netzwerk

A. C. Polatkan

K. Nieselt

Patrick Haug

Aug.

2012

Extrahierung und Klassifizierung von Microblogging-Inhalten mit Anwendung auf bioinformatische Themen

A. C. Polatkan

K. Nieselt

Jonas Begemann

Nov.

2012

Genomweite Expressionsanalyse mesenchymaler Stammzellen

K. Nieselt

Prof. Aicher

Andre Hennig

Aug.

2011

Transcript Count Statistics for Expression Studies from Second-Generation Sequencing Data

F. Battke

K. Nieselt

Dilek Tuncbilek

Aug.

2011

Interaktive Visualisierung von systembiologischen Daten

K. Nieselt

S. Symons

Matthias Munz

Feb.

2011

Vergleich von Vorhersage-Verfahren für non-coding RNAs in Bakterien

K. Nieselt

A. Herbig

Philipp Kirstahler

Feb.

2011

Sequence based filtering of RNA-RNA interaction candidates

K. Nieselt

A. Herbig

Julian Gutekunst

Feb.

2011

Fast alignment methods of RNA-sequencing data

K. Nieselt

F. Battke

Björn Petri

Feb.

2011

Detecting and modelling time shifts in microarray time series data applying Gaussian processes

K. Nieselt

O. Stegle (MPI)

Max Zwießele

Sept.

2010

Experimentelle Annotation der Transkriptionslandschaften von Candida albicans und Candida dubliniensis

K. Nieselt

K. Sohn (IGB)

Philip Stevens

Sept.

2010

Automatisierung von Mayday mit Java Scripta>

K. Nieselt

F. Battke

Tobias Ries

Sept.

2010

Statistical Data Analysis for the Detection of Differentially Expressed Genes

K. Nieselt

S. Symons

Sina Beier

Aug.

2009

Motif finding in Mayday

K. Nieselt

F. Battke

Frederik Weber

Sept.

2009

QT-Clustering für Mayday

K. Nieselt

J. Dietzsch

Günter Jäger

Aug.

2008

Erstellung eines effizienten Visualisierungs-Frameworks für Mayday

K. Nieselt

F. Battke

Philipp Bruns

Sept.

2008

Regulatorische Netzwerke mit Association-Mining

K. Nieselt

S. Symons

Christian Sieber

Sept.

2008

Datenbank und Analyse von Immunologie-Expressionsdaten

K. Nieselt

S. Symons

Steffen Sass Sept. 2008

Abgeschlossene Diplomarbeiten

Thema BetreuerIn BearbeiterIn Be-endet
Schnelle und interaktive Clusterverfahren für Transkriptomdaten von Cyanobakterien

G. Jäger

K. Nieselt

Jennifer Lange

Sep.

2012

Kooperative Analyse von Hochdruchsatzdaten aus heterogenen Quellen durch Einbindung von Gaggle in Mayday

K. Nieselt

M. Bonin

Claudia Broelemann

Okt.

2011

Statistische Verfahren zur linearen und nicht-linearen Merkmalsextraktion und Anwendungen bei der Visualisierung von Transkriptomdaten

K. Nieselt

M. Huber

Andreas Lehrmann

März

2011

Genomweite Vorhersage von ncRNA-Transkripten und ihre Validierung mit RNA-Seq

K. Nieselt

R. Backofen

Marc Rurik

Dez.

2010

Statistische Anreicherungsmethoden und -analysen auf azyklischen Graphen

K. Nieselt

O. Kohlbacher

Roland Keller

Aug.

2010

Entwicklung von Verfahren zur Berechnung von digitalen Expressionsprofilen aus “Next-Generation”-Sequenzierungstechnologien

S. Hüttner

K. Nieselt

H. G. Rammensee

Stephan Körner

Juli

2010

Nicht-negative Matrixfaktorisierung mit Anwendung auf Motifsuche in Promotorregionen

K. Nieselt

G. Raetsch

Sebastian Nerz

Juni

2010

Genome-wide comparison of pathogenic and nonpathogenic staphylococci

K. Nieselt

F. Goetz

Stefan Raue

Mai

2010

Detection and Annotation of non-coding RNAs in Staphylococci

K. Nieselt

F. Goetz

Daniel Lehle

Mai

2010

Progressives Partial Order Alignment mit Anwendung auf Transkriptionsfaktorbindungsstellen

K. Nieselt

R. Sommer (MPI)

Georgios Papadopoulos

Nov.

2009

Skalierbare Methoden zur interaktiven Visualisierung genomweiter Genexpressionsdaten

K. Nieselt

D. Bartz (Uni

Leipzig)

Christian Zipplies

Juni

2009

Algorithms for the integrated analysis of ChIP-chip, ChIP-seq and mRNA expression data

K. Nieselt

C. Müller-Tidow

(Uniklinik Münster)

Lucia Spangenberg

Juni

2009

COAT: Cross Organism Analysis Toolkit

K. Nieselt

T. Rasse

(Hertie-Institut)

Hannes Angst

April

2009

Illumina array algorithms for Mayday

K. Nieselt

M. Bonin

Nastasja Trunk

März

2009

Algorithmen zur Merkmalsselektion aus Expressionsexperimenten zur Klassifikation multipler Tumortypen

K. Nieselt

C. Müller-Tidow

(Uniklinik Münster)

Karin Zimmermann

Sept.

2008

Visualization and clustering of the expression content of multiple groups using barycentric coordinates

K. Nieselt

M. Bonin

Stephan Gade

Juli

2008

Classification of non-coding RNAs in prokaryotes

K. Nieselt

E. Takano

(Uni. Groningen)

Alexander Herbig

Juni

2008

Algorithmen zur Identifizierung rhythmischer Expressionsmuster

K. Nieselt

D. Zieker

H. Northoff

(Transfusions-

medizin IKET)

Katharina Buck

Mai

2008

SpRay: Eine Visual-Analytics-Plattform für hochdimensionale Daten

K. Nieselt

J. Dietzsch

D. Bartz

(Uni Leipzig)

Julian Heinrich

Feb.

2008

XML als Werkzeug zur Verwaltung und Integration von Microarray-Daten

K. Nieselt

O. Kohlbacher

Claas Eggert

Jan.

2008

OrthoExpress: Organismenübergreifende Expressionsanalysen aus multiplen Experimenttypen

K. Nieselt

T. Rasse

(Hertie-Institut Tü)

Michael Knopp

Nov.

2007

Oligo hybridisation quality control for ChIP-Chip applications and combinatorial analysis of epigenetic modifications in promotor regions

K. Nieselt

C. Müller-Tidow

(Uniklinik Münster)

Florian Battke

Nov.

2007

Structural Analysis of Natural Antisense transcripts

K. Nieselt

S. Steigele

P. Stadler

(Uni Leipzig)

Mathias Ganter

Sept.

2007

Expression correlation of natural antisense transcripts in bacterial transcriptomes

K. Nieselt

E. Takano (Univ. Groningen)

Christian Bender

Sept.

2007

Robuste Merkmalsselektion aus Bipartitionen von Microarray-Expressionsdaten mit Anwendungen auf aggregierte Tumordaten

K. Nieselt

D. Zieker

A. Königrainer

(UKT)

Christian Schillinger

Aug.

2007

Molekulare Signaturen primärer intestinaler Tumore

K. Nieselt

D. Zieker

A. Königsrainer

(Klinikum Tübingen)

Bettina Knapp

Aug.

2007

Molekulare Evolution im Guppy

C. Dreyer (MPI)

K. Nieselt

Eva-Maria Willing

Jan.

2007

Comparative Analysis of Genome Architecture in Caenorhabditis

C. Dieterich (MPI)

K. Nieselt

Christian Rödelsperger

Dez.

2006

Funktionelle Analyse von Genexpressionsdaten und Visualisierung beteiligter metabolischer Netzwerke (in Kollaboration mit Uniklinik Tübingen, PD Fehm)

K. Nieselt

H. Neubauer

Katrin Deubel

Aug.

2006

A survey of Natural Antisense Transcripts in the bacteria and archaea kingdoms

K. Nieselt

W. Wohlleben

Markus Riester

Juli

2006

Machine learning algorithms for Microarray Data

K. Nieselt

O. Kohlbacher

Stephan Symons

April

2006

Comparative Analysis and Visualization of Epigenomic and Gene Expression Microarray Data

K. Nieselt

C. Müller-Tidow

Matthias Zschunke

März

2006

Visualization and Integration of LC/MS Proteomics Data

K. Nieselt

L. Hood

(ISB Seattle)

Nils Gehlenborg

März

2006

New Results on Evolutionary Trees: Closure Operations, Generalised Convexity and Generating Functions

K. Nieselt

D. Huson

Tobias Thierer

Dez.

2005

Verbesserte Graphische Oberfläche und Algrothmen für Affymetrix® Resequenzierungs-Microarrays

K. Nieselt

O. Rieß

Kirstin Weber

Dez.

2005

Genomweite Rekonstruktion und experimenteller Nachweis repetitiver Elemente aus hochfragmentierten Sequenzdaten

R. Sommer (MPI)

S. Steigele

K. Nieselt

Alexander Breit Mai 2005
3did: a structural framework for second generation prediction algorithms of protein-protein interactions (in Kollaboration mit EMBL Heidelberg Dr. Patrick Aloy)

P. Aloy

K. Nieselt

Amelie Stein Mai 2005
Genome-wide analysis of growth-phase dependent genes in Streptomyces coelicolor

W. Wohlleben

K. Nieselt

Daniela Eggle März 2005

Abgeschlossene extern betreute Diplomarbeiten

Thema BetreuerIn BearbeiterIn Beendet
Graph-theoretical Approaches to the Multiple Sequence Alignment Problem Michael Kaufmann/Kay Nieselt Jonas Müller April 2010
Genome-wide identification and characterization of HOX targets based on ChIP-seq data and in silico methods Kay Nieselt/Detlef Weigel Michael Piechotta August 2009
Improving Gene Finding Accuracy with Tiling Array and RNA-Seq Data Kay Nieselt/Dr. Gunnar Raetsch (MPI Tübingen) Jonas Behr August 2008
Analysis of small RNA pathway mutants using whole genome tiling arrays Kay Nieselt/Prof. D. Weigel (MPI Tübingen) Timo Sachsenberg September 2008
Analysis of alternative transcripts in Arabidopsis thaliana with whole genome arrays Kay Nieselt/Dr. Gunnar Raetsch (MPI Tübingen) Johannes Eichner Juli 2008
Maximale Cliquen in c-max-Toleranzgraphen und ihre Anwendung in der Gruppierung molekularer Sequenzen Kay Nieselt/Michael Kaufmann / Katharina Anna Lehmann Ulrike Schöck März 2007
On Small-World Networks Michael Kaufmann/Kay Nieselt Hendrik Post August 2005

Abgeschlossene Studienarbeiten

Thema BetreuerIn BearbeiterIn
Using whole genome tiling microarray for gene expression analysis in Drosophila melanogaster Kay Nieselt/Steven Henikoff Martin Riedel
Ein interaktiver TreeBrowser von Microarraydaten und splitinduzierte Merkmalsselektion Kay Nieselt Thomas Löffler
Microarray-Analyse in Cyanobakterien Kay Nieselt/Prof. K. Forchhammer Jennifer Lange
Antisense-Transkripte in Staphylokokken Kay Nieselt Gideon Zipprich
GlnR Regulation in Actinomycetes Kay Nieselt/Jens Reuther Lars Rosenbaum
A HMM based gene finder for Pristionchus pacificus Kay Nieselt/Christoph Dieterich Alexander Herbig
Extending Parallel Coordinates for Bioinformatical Applications Kay Nieselt/Janko Dietzsch/Dieter Bartz Julian Heinrich
Evolution of Gene Structure Kay Nieselt/Christoph Dieterich/Ralf Sommer Patrick Sobetzko
Implementation of a Generic Pipeline for Genomic signal Prediction Kay Nieselt/Gunnar Rätsch Jonas Behr
EISEV – Ein Programmm zur Betrachtung der Evolution von Exon-Intron-Strukturen Kay Nieselt/Christoph Dieterich Thomas Müller
Theoretical and practical QTL mapping Pristionchus pacificus Kay Nieselt/Christoph Dieterich Stephanie Gursch
Theoretical and practical QTL mapping Pristionchus pacificus Kay Nieselt/Christoph Dieterich Andrea Sprecher
Phylogenetische Profile von Transkriptionsfaktorbindungsstellen in Hefestämmen Kay Nieselt/Christoph Dieterich Georgios Papadopoulos
Textmining in Mayday Kay Nieselt Michael Piechotta
Non-coding RNA detection and characterization in Neisseria meningitidis Kay Nieselt Stephan Körner
Visualisierung von NAT-Netzwerken Kay Nieselt Marc Rurik
A Mayday plugin for Affymetrix chip analysis Kay Nieselt/Stephan Symons Anna Jasper
A visualisation plugin for Microarray Quality Control in Mayday Kay Nieselt/Stephan Symons Nastasja Trunk
Eine Pipeline zur automatischen genomweiten Detektion und Annotation von Antisense-Transkripten Kay Nieselt/Stephan Steigele Jörg Hagmann
Eine Pipeline zum automatischen, genomweiten Primer-Design von kodierenden und nicht-kodierenden Genen Kay Nieselt/Eriko Takano (Univ. Groningen) Klaus Kopec
High-throughput automization of annotation of antisense transcripts in many genomes Kay Nieselt/Stephan Steigele Claudia Eisbrenner
Genomweite Vorhersage von nicht-kodierenden RNA-Genen in Streptomyzeten Kay Nieselt/Stephan Steigele Jonas Müller
Konvergierende Phylogenien Kay Nieselt/Stephan Steigele Michael Hagmann
A Graphical Filtering Framework for Mayday Kay Nieselt/Janko Dietzsch Florian Battke
Detektion biologischer Repeats mit Hilfe von Suffixbäumen Stephan Steigele/Kay Nieselt Britta Hagmeyer
Implementierung von Clusterverfahren in Mayday (in Kollaboration mit MPI f. Entwicklungsbiologie, Prof. D. Weigel, Dr. Stefan Henz ) Janko Dietzsch/Stefan Henz (externer Betreuer)/Kay Nieselt Markus Riester
Microarray-Datenbank höherer Eukaryonten mit Anbindung an Mayday Janko Dietzsch/Kay Nieselt Stephan Symons
Erstellung einer Graphischen Benutzeroberfläche und von Sequenzclusterprogrammen im Rahmen des Projekts PhyloPipe Stephan Steigele/Kay Nieselt Ralf Eilbracht
PhyloPipe: Pipeline zur automatischen Rekonstruktion von Phylogenien Stephan Steigele/Kay Nieselt Jan Philipp Meier-Kolthoff
Anbindung von R in Mayday Janko Dietzsch/Kay Nieselt Matthias Zschunke
Detektion und Annotation von Repeats in Pristionchus pacificus Stephan Steigele/Kay Nieselt Alexander Breit
Integration von Quartett-Mapping in jSPLITS Kay Nieselt/Tobias Klöpper Kristoffer Forslund
Visualisierung von geclusterten Genexpressionsdaten Janko Dietzsch / Kay Nieselt Nils Gehlenborg
Genomweite in silico Detektion und Annotation von Natürlichen Antisense Transkripten inSaccharomyces cerevisiae Stephan Steigele/Kay Nieselt Daniela Eggle
J-iQMAP: interactive Quartet Mapping in Java Janko Dietzsch/Kay Nieselt Carola Huthmacher
Integration von VMATCH und RepeatMasker Stephan Steigele/Kay Nieselt Kirstin Weber
Detektion von Motiven in regulatorischen Regionen mit Signaltransformationen Janko Dietzsch/Kay Nieselt Marc Röttig