Alina Renz

MSc. in Bioinformatik

Büro

Institut für Informatik
Institut für Biomedizinische Informatik (IBMI)
Sand 14 ・ Erdgeschoss ・ Raum C106
 +49 7071 29-70488
renzspam prevention@informatik.uni-tuebingen.de


Forschungsinteressen

  • Molekularbiologie / Molekulare Medizin:
    Molekulare, biochemische und metabolische Mechanismen in Pro- und Eukaryoten in Gesundheit und Krankheit

  • Systembiologie: 
    Einschränkungsbasierte Modellierung von metabolischen Netzwerken

  • Visualisierung:
    Visualisierung metabolischer Prozesse von genom-skaligen metabolischen Netzwerken 


Aktuelle Forschungsprojekte

Computer-Modellierung und experimentelle Überprüfung mikrobieller Interaktionen
Exploratives Projekt

Gefördert durch die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, doi:10.13039/501100001659) unter der Exzellenzstrategie des Bundes – EXC 2124 – 390838134 und unterstützt durch das Exzellenzcluster CMFI (Kontrolle von Mikroorganismen zur Bekämpfung von Infektionen).

Rechnergestützte Systembiologie der Infektionen und antimikrobiell-resistenten Pathogene

Das Projekt TTU 08.703 wird unter Förderkennzeichen 8020708703 durch das Deutsche Zentrum für Infektionsforschung (DZIF, doi:10.13039/100009139) innerhalb der Deutschen Zentren der Gesundheitsforschung (BMBF-DZG des Bundesministeriums für Bildung und Forschung) gefördert.


Abgeschlossene Forschungsprojekte

Konzeptionelle Gestaltung einer deutschen infektionsbezogenen OMICS Datenaustausch Plattform (GirOD)

Publikationen

Longitudinal multi-omics analyses identify responses of megakaryocytes, erythroid cells and plasmablasts as hallmarks of severe COVID-19 trajectories

Joana P. Bernardes, Neha Mishra, Florian Tran, Thomas Bahmer, Lena Best, Johanna I. Blase, Dora Bordoni, Jeanette Franzenburg, Ulf Geisen, Jonathan Josephs-Spaulding, Philipp Köhler, Axel Künstner, Elisa Rosati, Anna C. Aschenbrenner, Petra Bacher, Nathan Baran, Teide Boysen, Burkhard Brandt, Niklas Bruse, Jonathan Dörr, Andreas Dräger, Gunnar Elke, David Ellinghaus, Julia Fischer, Michael Forster, Andre Franke, Sören Franzenburg, Norbert Frey, Anette Friedrichs, Janina Fuß, Andreas Glück, Jacob Hamm, Finn Hinrichsen, Marc P. Höppner, Simon Imm, Ralf Juenker, Sina Kaiser, Ying H. Kan, Rainer Knoll, Christoph Lange, Georg Laue, Clemes Lier, Matthias Lindner, Georgios Marinos, Robert Markewitz, Jacob Nattermann, Rainer Noth, Peter Pickkers, Klaus F. Rabe, Alina Renz, Christoph Röcken, Jan Rupp, Annika Schaffarzyk, Alexander Scheffold, Jonas Schulte-Schrepping, Domagoj Schunck, Dirk Skowasch, Thomas Ulas, Klaus-Peter Wandinger, Michael Wittig, Johannes Zimmermann, Hauke Busch, Bimba F. Hoyer, Christoph Kaleta, Jan Heyckendorf, Matthijs Kox, Jan Rybniker, Stefan Schreiber, Joachim Schultze und Philip Rosenstiel.
Immunity, 26. November 2020.
[ Details | DOIMedRxiv | PDF | PubMed | BibTeX ]

COVID-19 Disease Map, a computational knowledge repository of SARS-CoV-2 virus-host interaction mechanisms

Marek Ostaszewski, Anna Niarakis, Alexander Mazein, Inna Kuperstein, Robert Phair, Aurelio Orta-Resendiz, Vidisha Singh, Sara Sadat Aghamiri, Marcio Luis Acencio, Enrico Glaab, Andreas Ruepp, Gisela Fobo, Corinna Montrone, Barbara Brauner, Goar Frishman, Luis Cristóbal Monraz Gómez, Julia Somers, Matti Hoch, Shailendra Kumar Gupta, Julia Scheel, Hanna Borlinghaus, Tobias Czauderna, Falk Schreiber, Arnau Montagud, Miguel Ponce de Leon, Akira Funahashi, Yusuke Hiki, Noriko Hiroi, Takahiro G. Yamada, Andreas Dräger, Alina Renz, Muhammad Naveez, Zsolt Bocskei, Francesco Messina, Daniela Börnigen, Liam Fergusson, Marta Conti, Marius Rameil, Vanessa Nakonecnij, Jakob Vanhoefer, Leonard Schmiester, Muying Wang, Emily E. Ackerman, Jason E. Shoemaker, Jeremy Zucker, Kristie L. Oxford, Jeremy Teuton, Ebru Kocakaya, Gökçe Yağmur Summak, Kristina Hanspers, Martina Kutmon, Susan Coort, Lars Eijssen, Friederike Ehrhart, Rex D. A. B., Denise Slenter, Marvin Martens, Robin Haw, Bijay Jassal, Lisa Matthews, Marija Orlic-Milacic, Andrea Senff-Ribeiro, Karen Rothfels, Veronica Shamovsky, Ralf Stephan, Cristoffer Sevilla, Thawfeek Mohamed Varusai, Jean-Marie Ravel, Rupsha Fraser, Vera Ortseifen, Silvia Marchesi, Piotr Gawron, Ewa Smula, Laurent Heirendt, Venkata Satagopam, Guanming Wu, Anders Riutta, Martin Golebiewski, Stuart Owen, Carole Goble, Xiaoming Hu, Rupert Overall, Dieter Maier, Angela Bauch, John A. Bachman, Benjamin M Gyori, Carlos Vega, Valentin Grouès, Miguel Vazquez, Pablo Porras, Luana Licata, Marta Iannuccelli, Francesca Sacco, Denes Turei, Augustin Luna, Ozgun Babur, Sylvain Soliman, Alberto Valdeolivas, Marina Esteban-Medina, Maria Peña-Chilet, Tomáš Helikar, Bhanwar Lal Puniya, Anastasia Nesterova, Anton Yuryev, Anita de Waard, Dezso Modos, Agatha Treveil, Marton Laszlo Olbei, Bertrand De Meulder, Aurélien Naldi, Aurélien Dugourd, Vincent Noël, Laurence Calzone, Chris Sander, Emek Demir, Tamas Korcsmaros, Tom C. Freeman, Franck Augé, Jacques S. Beckmann, Jan Hasenauer, Olaf Wolkenhauer, Egon Willighagen, Alexander R. Pico, Chris Evelo, Marc Gillespie, Lincoln D. Stein, Henning Hermjakob, Peter DʼEustachio, Julio Saez-Rodriguez, Joaquin Dopazo, Alfonso Valencia, Hiroaki Kitano, Emmanuel Barillot, Charles Auffray, Rudi Balling, Reinhard Schneider und die COVID-19-Gemeinschaft für die Erstellung von Krankheitskarten
BioRxiv, 28. Oktober 2020.
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Clinical Applications of Metabolic Models in SBML Format

Alina Renz, Reihaneh Mostolizadeh und Andreas Dräger
Reference Module in Biomedical Sciences, Elsevier, 30. Januar 2020.
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