Aktuelle Stellenausschreibungen

Postdoctoral researchers in Mathematical and Computational Population Genetics

The newly founded independent junior research group Mathematical and Computational Population Genetics headed by Franz Baumdicker at the University of Tuebingen has an opening for

Postdoctoral researchers (f/m/d)

The group develops and applies mathematical models and bioinformatic tools with a special focus on microbial evolution. We are interested in a variety of evolutionary scenarios including CRISPR Cas Evolution, Pan-Genome Evolution, Horizontal Gene Transfer, Fluctuation Selection, and Cooperation in Bacteria. The postdoc will work at the intersection of Mathematical Population Genetics / Computational Biology / Bioinformatics using mathematical population genetics, phylogenetics, statistical analysis, machine learning algorithms, and large scale simulations to derive new theoretical results, develop open source software and apply them to (microbial) genome data.
For scientific questions please contact fbaumdicker@gmx.de.
Candidate profiles we would love to see:
– PhD degree in (Bio-)Mathematics, Statistics, Bioinformatics, Computational Biology or a related field
– Interest in interdisciplinary research
– Strong mathematical preparation and interest
– Good computational skills (e.g. in Python, R)
– Independent, responsible and committed work
– Fluency in (scientific) English
What we offer:
– Salary according to TV-L, E13 (100%)
– The group is part of two Excellence Clusters (Controlling Microbes to Fight Infections & Machine Learning) in Tuebingen, which offers an excellent research environment with plenty of potential collaboration partners.
– Flexible starting date and possibility to start the project remotely in the initial phase
– Focus on research (no formal teaching duties)
– Responsibility to conduct your own research projects with a high amount of autonomy
Researchers from outside Germany are particularly encouraged to apply.
Applications and inquiries should be sent to office@cmfi.uni-tuebingen.de.
Please send your application as a single PDF file and include a brief statement on your interests and experience, CV (including a possible list of publications and the contact info of two academic references), and university transcripts. Severely disabled persons are given preferential consideration if they are equally suitable.
The review of applications will begin in October 2020 and continues until the positions are filled.

job offer as PDF

PhD students in Mathematical and Computational Population Genetics

The newly founded independent junior research group Mathematical and Computational Population Genetics headed by Franz Baumdicker at the University of Tuebingen has an opening for

PhD students (f/m/d)

The group develops and applies mathematical models and bioinformatic tools with a special focus on microbial evolution. We are interested in a variety of evolutionary scenarios including CRISPR-Cas Evolution and Dynamics, Pan-Genome Evolution, Horizontal Gene Transfer, Fluctuation Selection, and Cooperation in Bacteria. The PhD students will work at the intersection of Mathematical Population Genetics / Computational Biology / Bioinformatics using mathematical population genetics, phylogenetics, statistical analysis, machine learning algorithms, and large scale simulations to derive new results, develop open source software and apply them to (microbial) genome data.
For scientific questions contact fbaumdicker@gmx.de.
Candidate profiles we would love to see:
– Master’s degree in (Bio-)Mathematics, Statistics, Bioinformatics, Computational Biology or a related field
– Interest in interdisciplinary research
– Strong mathematical preparation and interest
– Good computational skills (e.g. in Python, R)
– Independent, responsible and committed work
– Fluency in (scientific) English
What we offer:
– Salary according to TV-L, E13 (65%)
– Dissertation at the Faculty of Natural Sciences working with two advisors
– The group is part of two Excellence Clusters (Controlling Microbes to Fight Infections & Machine Learning) in Tuebingen, which offers an excellent research environment with plenty of potential collaboration partners.
– Integration into the DFG priority programme SPP2141, where appropriate
– Focus on research (no formal teaching duties)
– Responsibility to conduct your own research projects with a high amount of autonomy
Researchers from outside Germany are particularly encouraged to apply.
Applications and inquiries should be sent to office@cmfi.uni-tuebingen.de.
Please send your application as a single PDF file and include a brief statement on your interests and experience, CV (including a possible list of publications and the contact info of two academic references), and university transcripts. Severely disabled persons are given preferential consideration if they are equally suitable.
The review of applications will begin in October 2020 and continues until the positions are filled.

job offer as PDF

Naturwissenschaftlicher Doktorand

Das Exzellenz-Cluster EXC 2124 “Controlling Microbes to Fight Infections” an der Universität Tübingen stellt ein:

Naturwissenschaftlicher Doktorand (m, w, d)

Medizinische Mikrobiologie und Hygiene,

im Bereich Interaktion von Pseudomonas aeruginosa mit anderen Gram-negativen Bakterien

Die Einstellung ist zum 01.11.2020 mit TV-L E13, 65% geplant, die Vertragszeit ist auf 3 Jahre befristet.

Geeignete Kandidaten haben einen Master-Abschluss oder einen gleichwertigen Abschluss in einem naturwissenschaftlichen Fach (Biologie, Biochemie o. ä.). Kenntnisse im Bereich Molekularbiologie und Mikrobiologie in Theorie und Praxis sind wünschenswert, aber keine Voraussetzung. Unser junges Team legt großen Wert auf soziale Kompetenz, Teamgeist, Engagement und begrüßt selbstständiges Denken und Arbeiten. Wir bieten Ihnen ein interessantes Thema, ein modernes Arbeitsumfeld mit gut ausgestatteten Labors, ein breites Methodenspektrum und eine gründliche Einarbeitung in alle Methoden.

Thema:
Pseudomonas aeruginosa ist ein opportunistischer Erreger, der häufig assoziert ist mit polymikrobiellen Infektionen, wie z.B. bei chirurgischen oder diabetischen Fußwunden und zystischer Fibrose. Die Interaktion solcher polymikrobieller Gemeinschaften kann sowohl mutualistisch als auch parasitisch sein und führt insgesamt oft zu einer erhöhten Virulenz.  Darüber hinaus ist P. aeruginosa häufig resistent gegen viele Antibiotika und seine Behandlung oft sehr schwierig.

Im Rahmen dieses vom Excellencluster „Controlling Microbes to Fight Infections (CMFI)“ geförderten Projektes sollen im Wesentlichen zwei Aspekte polymikrobieller Infektionen mit P. aeruginosa untersucht werden: 1) welchen Einfluss haben spezifische Proteine von P. aeruginosa auf dessen Fähigkeit, in polymikrobiellen Gemeinschaften bestehen zu können und 2) welche Rolle spielen diese Proteine für die Ausbildung von Resistenz gegenüber bestimmten Antibiotika. Ziel dieses Projektes ist es, mögliche Angriffspunkte für die Entwicklung neuartiger Therapien zur Behandlung von polymikrobiellen Infektionen insbesondere mit multiresistenten P. aeruginosa zu definieren. 

Schwerbehinderte werden bei gleicher Eignung vorrangig berücksichtigt. Die Universität Tübingen strebt eine Erhöhung des Anteils von Frauen beim wissenschaftlichen Personal an und bittet deshalb entsprechend qualifizierte Wissenschaftlerinnen nachdrücklich um ihre Bewerbung. Die Einstellung erfolgt über die Verwaltung des Klinikums.

Bitte richten Sie Fragen und Ihre Bewerbung mit den üblichen Unterlagen unter Angabe der Kennziffer CMFI_Bohn per email (alle Unterlagen zusammengefasst in eine einzige pdf-Datei) an:

PD Dr. rer. nat. Erwin Bohn
Universitätsklinikum Tübingen
Institut für Medizinische Mikrobiologie und Hygiene
Elfriede-Aulhorn-Str. 6
72076 Tübingen
erwin.bohn@med.uni-tuebingen.de