Exzellenzcluster – Kontrolle von Mikroorganismen zur Bekämpfung von Infektionen

Nachwuchsgruppen

Bastounis Lab

Wirtszellen interagieren mit bakteriellen Pathogenen in einem Milieu, das nicht nur von chemischen, sondern auch von mechanischen Signalen dominiert wird, einschließlich solcher, die aus der extrazellulären Umgebung oder von benachbarten Zellen stammen. Das Bastounis Lab möchte herausfinden, (i) wie Bakterien die zellulären Kräfte des Wirts ausnutzen, um ihre Vermehrung zu erleichtern, und (ii) welche biomechanischen Strategien die Wirtszellen anwenden, um die bakterielle Vermehrung zu behindern. Das Bastounis Lab möchte neuartige biomechanische Virulenzmechanismen und neue Aspekte der Mechanobiologie von Wirtszellen und Geweben entdecken.
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Baumdicker Lab

Fortschritte im Bereich der Sequenzierung haben unsere Sicht auf die Evolution und Ökologie dramatisch verändert, insbesondere bei Prokaryoten. Das Baumdicker Lab kombiniert mathematische Populationsgenetik, computational biology und Ansätze des maschinellen Lernens, um zu verstehen, wie die beobachtete Vielfalt von Mikroben entstanden ist und wie bakterielle Populationen kooperieren, um sich an ihre Umwelt anzupassen. Das Baumdicker Lab möchte unser Verständnis der Evolution der verteilten Bakteriengenome und der Populationsgeschichte der menschlichen Bevölkerung verbessern, indem es neue Methoden des maschinellen Lernen entwickelt.
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Jumpertz Lab

Adipositas und metabolische Erkrankungen wie Diabetes mellitus gehören zu den größten Gesundheitsherausforderungen westlicher und sich entwickelnder Gesellschaften. Ursachen für die Entwicklung der Adipositas beinhalten grundsätzlich eine Beeinflussung der Energiebilanz des Menschen. Die Absorption von Nahrung spielt eine wesentliche Rolle in der Energiebilanz-Regulation, allerdings gibt es bis heute kaum Erkenntnisse wie dies im Menschen reguliert ist. Diese Nachwuchsgruppe untersucht die der Entwicklung von metabolischen Krankheiten zu Grunde liegenden Mechanismen. Dabei liegt der Schwerpunkt auf der Untersuchung von Wechselwirkungen des Darmmikrobioms und des Wirtsmetabolismus an der Schnittstelle der intestinalen Nahrungsabsorption.
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Maier Lab

Der menschliche Körper, und insbesondere der Darm, bietet ein ideales Ökosystem für mikrobielle Gemeinschaften, die wiederum eine grundlegende Rolle in der menschlichen Physiologie und Pathologie spielen. Das Maier Lab untersucht die Stabilität von Mikrobengemeinschaften und ihre Fähigkeit, pathogene Mitglieder der Gemeinschaft in Schach zu halten und Eindringlinge zu bekämpfen. Es möchte verstehen, wie sich Medikamente auf Gemeinschaften auswirken können und untersuchen, ob man Medikamente einsetzen könnte, um ein gesundes Gleichgewicht wiederherzustellen.
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Molitor Lab

Methanogene sind Teil des menschlichen Darmmikrobioms, aber es ist nur sehr wenig über die Wechselwirkungen zwischen Methanogenen und dem Rest des Mikrobioms bekannt. Das Molitor Lab möchte (i) neue methanogen-spezifische Viren finden und (ii) die Interaktion dieser Viren mit ihren methanogenen Wirten untersuchen. Langfristiges Ziel ist es, den Einfluss von methanogenen Viren innerhalb mikrobieller Gemeinschaften in vivo zu untersuchen und diese Viren zur Modulation der Zusammensetzung von Mikrobiomen einzusetzen.

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Petras Lab

Wir sind in der Lage eine Vielzahl kleiner Moleküle in komplexen Umgebungen zu identifizieren und erlangen so Wissen über Tausende von Verbindungen, aber nur wenig Erkenntnis über deren ökologische Relevanz. Das Petras Lab will den Einfluss kleiner Moleküle auf komplexe mikrobielle Gemeinschaften bestimmen, indem es Expertise aus der Naturstoffforschung, Massenspektrometrie-basierter Metabolomik und Proteomik sowie chemischer Biologie zusammenführt. So sollen die Funktion von Naturstoffen in mikrobiellen Gemeinschaften verstanden und die Interaktion dieser Verbände mit dem Wirt genauer untersucht werden.
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Ratzke Lab

Mikroben leben normalerweise nicht isoliert, sondern zusammen mit vielen anderen Mikrobenarten in großen Gemeinschaften. Und dies sowohl in der Umwelt als auch auf und in unserem Körper. Trotz ihrer Bedeutung für die menschliche Gesundheit haben wir nur ein sehr begrenztes Verständnis der Mechanismen, die diese Gemeinschaften formen und steuern. Das langfristige Ziel des Ratzke Labs ist es zu verstehen, wie Interaktionen zwischen Mikroben mikrobielle Infektionen verhindern können und wie mikrobielle Gemeinschaften für medizinische Anwendungen modifiziert und konstruiert werden könnten.
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