TüSE Research strukturiert sich in drei Linien. Linie 1 umfasst alle ausschreibungsbezogenen Kooperationen und Projekte. Hier werden die relevanten Ausschreibungen sondiert, die vorhandene Expertise aus Bildungswissenschaften, Fächern und Fachdidaktiken koordiniert und integriert bis zur fertigen gemeinsamen Antragstellung. Die gemeinsamen Projekte werden sowohl von der TüSE als von den Akteuren aus den Bildungswissenschaften, den Fächern und den Fachdidaktiken geleitet und durchgeführt.