BIOINF1110 Einführung in die Bioinformatik
Online Vorlesung
Veranstaltung | BIOINF1110 Einführung in die Bioinformatik |
Dozenten | Prof. Manfred Claassen, Prof. Andreas Dräger, Prof. Daniel Huson, Prof. Oliver Kohlbacher, Prof. Michael Krone, Prof. Andrei Lupas, Prof. Kay Nieselt, Prof. Stephan Ossowski, Prof. Nico Pfeifer und Dr. Philipp Thiel |
Übungen | Keine Übungstermine, nur online Abgabe und Korrektur. Übungsblätter können in Gruppen von bis zu zwei Personen bearbeitet und abgegeben werden. Übungsleitung: Sascha Patz |
Ort und Zeit | Start: 20. April, 2020 Donnertags, 13:15-14h Dieses Semester wird diese Vorlesung online gehalten. Vorlesungsvideos sind ab den agegebenen Zeiten von Ilias downloadbar. (Nicht mehr in: Hörsaal N02, Morgenstelle) |
Für wen? | Nur für BSc Bioinformatik, Informatik oder Medizininformatik, Anmeldung über Ilias |
Prüfungsform | Es gibt eine Klausur am Ende des Semesters, die sich an den Übungsaufgaben orientiert |
Material | Vorlesungsaufzeichnungen in MP4 Format, Folien in PDF Format, Übungsaufgaben zum Selbststudium, auf Ilias |
Links | Alma Ilias |
Diese Veranstaltung vermittelt einen ersten Einblick in die Bioinformatik. Dazu werden in der Vorlesung ausgewählte Anwendungen der Bioinformatik kurz vorgestellt. Perspektivisch wird dabei erläutert, wie die in den ersten beiden Jahren des Bioinformatikstudiums vermittelten Grundlagenkenntnisse dabei zur Anwendung kommen. Die Themen decken grosse Teile Bioinformatik ab, variieren aber, um einen großen Aktualitätsbezug zu haben.
Es gibt wöchentliche Übungsblätter, die über Ilias herausgegeben und abgegeben werden. Übungsblätter können in Gruppen von bis zu zwei Personen bearbeitet und abgeben werden.
Es müssen mindestens 50% der Übungspunkte erreicht werden, um zur Klausur zugelassen zu werden. Wer 60%, 75% oder 90% aller Übungspunkte erreicht, erhält 2, 5 oder 8 (von 50) Bonuspunkte in der Klausur.
Die Klausur gilt als bestanden, wenn mindestens 50% der Klausurpunkte (ohne Bonuspunkte) erzielt wurden.
Wichtig: Alle abgegebenen Dateien (Übungen) müssen wie folgt benannt werden: (1) Ihr Name muss in der Dateiname enthalten sein, etwa so: Uebungsblatt1-Ben-Apfel.pdf (2) Ihr Name muss auch innerhalb der Datei erscheinen. Dateien, die nicht diese beiden Bedingungen erfüllen, werden nicht korrigiert. (Bei der Bearbeitung zu zweit, stets beide Namen angeben.)
Termin | Titel der Vorlesung | Dozent |
23.4. | 1. Von der DNA zur Datenbank - Sequenzierung & Assemblierung | Huson |
30.4. | 2. Aus einer Hand voll Erde – Metagenomik | Huson |
7.5. | 3. Designerdrogen – Wirkstoffe aus dem Rechner | Thiel |
14.5. | 4. Wie Stoffwechselmodelle potentielle Angriffsziele gegen SARS-CoV-2 vorhersagen | Dräger |
28.5. | 5. Das Mikroskop im Computer – Visualisierung molekularer Strukturen | Krone |
18.6. | 6. Der Teufel steckt im Detail - Methoden zur Analyse von einzelnen Zellen | Claassen |
25.6. | 7. Multi-OMICs - NGS für regulatorische Genetik | Ossowski |
2.7. | 8. Bioinformatische Methoden im Kampf gegen HIV | Pfeifer |
9.7. | 9. Impfen gegen Krebs – Bioinformatik im Impfstoffentwurf | Kohlbacher |
16.7. | 10. Die Sprache der Proteine – Evolution konservierter Proteinstrukturen | Lupas |
Do 23.7. 13:15-14:15 | Klausur in N06, Hörsaalgebäude Morgenstelle (gelb markierte Plätze) |
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Wer zur Klausur zugelassen wurde, aber die Klausur nicht bestanden hat (weniger als 50% der Punkte erreicht, oder nicht erschienen) kann die Nachklausur am Mittwoch, den 30.9. 9-10h, in F119 Sand 6/7 mitschreiben. Hier werden Bonuspunkte nicht berücksichtigt.