Abgeschlossene Studienarbeiten

Thema: Using whole genome tiling microarray for gene expression analysis in Drosophila melanogaster
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Henikoff
BearbeiterIn: Martin Riedel

Thema: Ein interaktiver TreeBrowser von Microarraydaten und splitinduzierte Merkmalsselektion
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Thomas Löffler

Thema: Microarray-Analyse in Cyanobakterien
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. K. Forchhammer
Bearbeiterin: Jennifer Lange

Thema: Antisense-Transkripte in Staphylokokken
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Gideon Zipprich

Thema: GlnR Regulation in Actinomycetes
BetreuerIn: K. Nieselt/J. Reuther
BearbeiterIn: Lars Rosenbaum

Thema: A HMM based gene finder for Pristionchus pacificus
BetreuerIn: K. Nieselt/C. Dieterich
BearbeiterIn: Alexander Herbig

Thema: Extending Parallel Coordinates for Bioinformatical Applications
BetreuerIn: K. Nieselt/J. Dietzsch/D. Bartz
BearbeiterIn: Julian Heinrich

Thema: Evolution of Gene Structure
BetreuerIn: K. Nieselt/C. Dieterich/R. Sommer
BearbeiterIn: Patrick Sobetzko

Thema: Implementation of a Generic Pipeline for Genomic signal Prediction
BetreuerIn: K. Nieselt/G. Rätsch
BearbeiterIn: Jonas Behr

Thema: EISEV – Ein Programmm zur Betrachtung der Evolution von Exon-Intron-Strukturen
BetreuerIn: K. Nieselt/C. Dieterich
BearbeiterIn: Thomas Müller

Thema: Theoretical and practical QTL mapping Pristionchus pacificus
BetreuerIn: K. Nieselt/C. Dieterich
BearbeiterIn: Stephanie Gursch

Thema: Theoretical and practical QTL mapping Pristionchus pacificus
BetreuerIn: K. Nieselt/C. Dieterich
BearbeiterIn: Andrea Sprecher

Thema: Phylogenetische Profile von Transkriptionsfaktorbindungsstellen in Hefestämmen
BetreuerIn: K. Nieselt/C. Dieterich
BearbeiterIn: Georgios Papadopoulos

Thema: Textmining in Mayday
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Michael Piechotta

Thema: Non-coding RNA detection and characterization in Neisseria meningitidis
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Stephan Körner

Thema: Visualisierung von NAT-Netzwerken
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Marc Rurik

Thema: A Mayday plugin for Affymetrix chip analysis
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Symons
BearbeiterIn: Anna Jasper

Thema: A visualisation plugin for Microarray Quality Control in Mayday
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Symons
BearbeiterIn: Nastasja Trunk

Thema: Eine Pipeline zur automatischen genomweiten Detektion und Annotation von Antisense-Transkripten
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Steigele
BearbeiterIn: Jörg Hagmann

Thema: Eine Pipeline zum automatischen, genomweiten Primer-Design von kodierenden und nicht-kodierenden Genen
BetreuerIn: K. Nieselt/E. Takano (Uni Groningen)
BearbeiterIn: Klaus Kopec

Thema: High-throughput automization of annotation of antisense transcripts in many genomes
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Steigele
BearbeiterIn: Claudia Eisbrenner

Thema: Genomweite Vorhersage von nicht-kodierenden RNA-Genen in Streptomyzeten
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Steigele
BearbeiterIn: Jonas Müller

Thema: Konvergierende Phylogenien
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Steigele
BearbeiterIn: Michael Hagmann

Thema: A Graphical Filtering Framework for Mayday
BetreuerIn: K. Nieselt/J. Dietzsch
BearbeiterIn: Florian Battke

Thema: Detektion biologischer Repeats mit Hilfe von Suffixbäumen
BetreuerIn: S. Steigele/K. Nieselt
BearbeiterIn: Britta Hagmeyer

Thema: Implementierung von Clusterverfahren in Mayday (in Kollaboration mit MPI f. Entwicklungsbiologie, Prof. D. Weigel, Dr. Stefan Henz )
BetreuerIn: J. Dietzsch/S. Henz (externer Betreuer)/K. Nieselt
BearbeiterIn: Markus Riester

Thema: Microarray-Datenbank höherer Eukaryonten mit Anbindung an Mayday
BetreuerIn: J. Dietzsch/K. Nieselt
BearbeiterIn: Stephan Symons

Thema: Erstellung einer Graphischen Benutzeroberfläche und von Sequenzclusterprogrammen im Rahmen des Projekts PhyloPipe
BetreuerIn: S. Steigele/K. Nieselt
BearbeiterIn: Ralf Eilbracht

Thema: PhyloPipe: Pipeline zur automatischen Rekonstruktion von Phylogenien
BetreuerIn: S. Steigele/K. Nieselt
BearbeiterIn: Jan Philipp Meier-Kolthoff

Thema: Anbindung von R in Mayday
BetreuerIn: J. Dietzsch/K. Nieselt
BearbeiterIn: Matthias Zschunke

Thema: Detektion und Annotation von Repeats in Pristionchus pacificus
BetreuerIn: S. Steigele/K. Nieselt
BearbeiterIn: Alexander Breit

Thema: Integration von Quartett-Mapping in jSPLITS
BetreuerIn: K. Nieselt/T. Klöpper
BearbeiterIn: Kristoffer Forslund

Thema: Visualisierung von geclusterten Genexpressionsdaten
BetreuerIn: J. Dietzsch/K. Nieselt
BearbeiterIn: Nils Gehlenborg

Thema: Genomweite in silico Detektion und Annotation von Natürlichen Antisense Transkripten inSaccharomyces cerevisiae
BetreuerIn: S. Steigele/K. Nieselt
BearbeiterIn: Daniela Eggle

Thema: J-iQMAP: interactive Quartet Mapping in Java
BetreuerIn: J. Dietzsch/K. Nieselt
BearbeiterIn: Carola Huthmacher

Thema: Integration von VMATCH und RepeatMasker
BetreuerIn: S. Steigele/K. Nieselt
BearbeiterIn: Kirstin Weber

Thema: Detektion von Motiven in regulatorischen Regionen mit Signaltransformationen
BetreuerIn: J. Dietzsch/K. Nieselt
BearbeiterIn: Marc Röttig