Professor Dr. Dr. h. c. Franz W.Wagner ist Mitglied in folgenden wissenschaftlichen Vereinigungen:
- Verband der Hochschullehrer für Betriebswirtschaft: Kommission "Rechnungswesen"; Kommission "Betriebswirtschaftliche Steuerlehre" (Vorsitz von 1987-1989)
- Verein für Socialpolitik: Ausschuß "Unternehmensrechnung" (Vorsitz 1991-1995)