Die Dräger-Forschungsgruppe (gegründet im Juli 2018) wendet computergestützte Systembiologie an, wobei der Schwerpunkt auf Infektionen und antimikrobiell resistenten Erregern liegt. Die Forschungsarbeiten umfassen alle Schritte vom biologischen Phänomen bis zu seiner Simulation im Rechner, einschließlich der Rekonstruktion biologischer Systeme, ihrer mathematischen Modellierung, der Standardisierung dieser Modelle, der Entwicklung spezialisierter Softwarelösungen sowie der Anwendung maschinellen Lernens und Datenvisualisierung. Die Ableitung modellgestützter neuer Hypothesen zur systematischen Bekämpfung der zunehmenden Antibiotikaresistenz gilt als vorrangiges Ziel.
FROG Analysis Ensures the Reproducibility of Genome Scale Metabolic Models K. Raman, M. Kratochvíl, B. G. Olivier, M. König, P. Sengupta, D. K. K. Baskaran, T. V. N. Nguyen, D. Lobo, S. E. Wilken, K. K. Tiwari, A. K. Raghu, I. Palanikumar, L. Raajaraam, M. Ibrahim, S. Balakrishnan, S. Umale, F. T. Bergmann, T. Malpani, V. P. Satagopam, R. Schneider, M. E. Beber, S. M. Keating, M. Anton, A. Renz, M. Lakshmanan, D.-Y. Lee, L. Koduru, R. Mostolizadeh, O. Dias, E. Cunha, A. Oliveira, Y. Q. Lee, K. Zengler, R. Santibáñez-Palominos, M. Kumar, M. Barberis, B. L. Puniya, T. Helikar, H. V. Dinh, P. F. Suthers, C. D. Maranas, I. Casini, S. B. Loghmani, N. Veith, N. Leonidou, F. Li, Y. Chen, J. Nielsen, G. Lee, S. M. Lee, G. B. Kim, P. T. Monteiro, M. C. Teixeira, H. U. Kim, S. Y. Lee, U. W. Liebal, L. M. Blank, C. Lieven, C. Tarzi, C. Angione, M. E. Blaise, Ç. P. Aytar, M. Kulyashov, l. Akberdin, D. Kim, S. H. Yoon, Z. Xu, J. Gautam, W. T. Scott, P. J. Schaap, J. J. Koehorst, C. Zuñiga, G. Canto-Encalada, S. Benito-Vaquerizo, I. P. Olm, M. Suarez-Diez, Q. Yuan, H. Ma, M. M. Islam, J. A. Papin, F. Zorrilla, K. R. Patil, A. Basile, J. Nogales, G. San León, F. Castillo-Alfonso, R. Olivares-Hernández, G. Vigueras-Ramírez, H. Hermjakob, A. Dräger und R. S. Malik-Sheriff BioRxiv, 26. September 2024 [ Details | DOI | PDF | PubMed | BibTeX ]
Standard-GEM: Standardization of open-source genome-scale metabolic models M. Anton, E. Almaas, R. Benfeitas, S. Benito-Vaquerizo, L. M. Blank, A. Dräger, J. M. Hancock, C. Kittikunapong, M. König, F. Li, U. W. Liebal, H. Lu, H. Ma, R. Mahadevan, A. Mardinoglu, J. Nielsen, J. Nogales, M. Pagni, J. A. Papin, K. R. Patil, N. D. Price, J. L. Robinson, B. J. Sánchez, M. Suarez Diez, S. Sulheim, L. T. Svensson, B. Teusnik, W. Vongsangnak, H. Wang, A. A. Zeidan, and E. J. Kerkhoven BioRxiv, 23. März 2023. [ Details | DOI | PDF | PubMed | BibTeX ]