Die Arbeit des EIBOR konkretisiert sich in verschiedenen Projekten, die unterschiedliche Schwerpunkte setzen. Während einige sich auf den Bereich der interelligiös-interkulturell sensiblen Bildung konzentrieren, sind andere eher der strukturellen Frage nach der Organisation des Religionsunterrichts an Beruflichen Schulen zuzuordnen. Wieder andere fragen nach dem Glauben oder den Werten von Jungendlichen in dieser Lebensphase.
Das verbindene Element aller Projekte ist die Frage, wie Religionsunterricht an Beruflichen Schulen unter den aktuellen Bedingungen von Politik, Gesellschaft und Kirche umgesetzt und weiterentwickelt werden kann.