Complete Term Papers

Topic: Using whole genome tiling microarray for gene expression analysis in Drosophila melanogaster
Supervisor: K. Nieselt/S. Henikoff
Author: Martin Riedel

Topic: Ein interaktiver TreeBrowser von Microarraydaten und splitinduzierte Merkmalsselektion
Supervisor: K. Nieselt
Author: Thomas Löffler

Topic: Microarray-Analyse in Cyanobakterien
Supervisor: K. Nieselt/Prof. K. Forchhammer
Author: Jennifer Lange

Topic: Antisense-Transkripte in Staphylokokken
Supervisor: K. Nieselt
Author: Gideon Zipprich

Topic: GlnR Regulation in Actinomycetes
Supervisor: K. Nieselt/J. Reuther
Author: Lars Rosenbaum

Topic: A HMM based gene finder for Pristionchus pacificus
Supervisor: K. Nieselt/C. Dieterich
Author: Alexander Herbig

Topic: Extending Parallel Coordinates for Bioinformatical Applications
Supervisor: K. Nieselt/J. Dietzsch/D. Bartz
Author: Julian Heinrich

Topic: Evolution of Gene Structure
Supervisor: K. Nieselt/C. Dieterich/R. Sommer
Author: Patrick Sobetzko

Topic: Implementation of a Generic Pipeline for Genomic signal Prediction
Supervisor: K. Nieselt/G. Rätsch
Author: Jonas Behr

Topic: EISEV – Ein Programmm zur Betrachtung der Evolution von Exon-Intron-Strukturen
Supervisor: K. Nieselt/C. Dieterich
Author: Thomas Müller

Topic: Theoretical and practical QTL mapping Pristionchus pacificus
Supervisor: K. Nieselt/C. Dieterich
Author: Stephanie Gursch

Topic: Theoretical and practical QTL mapping Pristionchus pacificus
Supervisor: K. Nieselt/C. Dieterich
Author: Andrea Sprecher

Topic: Phylogenetische Profile von Transkriptionsfaktorbindungsstellen in Hefestämmen
Supervisor: K. Nieselt/C. Dieterich
Author: Georgios Papadopoulos

Topic: Textmining in Mayday
Supervisor: K. Nieselt
Author: Michael Piechotta

Topic: Non-coding RNA detection and characterization in Neisseria meningitidis
Supervisor: K. Nieselt
Author: Stephan Körner

Topic: Visualisierung von NAT-Netzwerken
Supervisor: K. Nieselt
Author: Marc Rurik

Topic: A Mayday plugin for Affymetrix chip analysis
Supervisor: K. Nieselt/S. Symons
Author: Anna Jasper

Topic: A visualisation plugin for Microarray Quality Control in Mayday
Supervisor: K. Nieselt/S. Symons
Author: Nastasja Trunk

Topic: Eine Pipeline zur automatischen genomweiten Detektion und Annotation von Antisense-Transkripten
Supervisor: K. Nieselt/S. Steigele
Author: Jörg Hagmann

Topic: Eine Pipeline zum automatischen, genomweiten Primer-Design von kodierenden und nicht-kodierenden Genen
Supervisor: K. Nieselt/E. Takano (Uni Groningen)
Author: Klaus Kopec

Topic: High-throughput automization of annotation of antisense transcripts in many genomes
Supervisor: K. Nieselt/S. Steigele
Author: Claudia Eisbrenner

Topic: Genomweite Vorhersage von nicht-kodierenden RNA-Genen in Streptomyzeten
Supervisor: K. Nieselt/S. Steigele
Author: Jonas Müller

Topic: Konvergierende Phylogenien
Supervisor: K. Nieselt/S. Steigele
Author: Michael Hagmann

Topic: A Graphical Filtering Framework for Mayday
Supervisor: K. Nieselt/J. Dietzsch
Author: Florian Battke

Topic: Detektion biologischer Repeats mit Hilfe von Suffixbäumen
Supervisor: S. Steigele/K. Nieselt
Author: Britta Hagmeyer

Topic: Implementierung von Clusterverfahren in Mayday (in Kollaboration mit MPI f. Entwicklungsbiologie, Prof. D. Weigel, Dr. Stefan Henz )
Supervisor: J. Dietzsch/S. Henz (externer Betreuer)/K. Nieselt
Author: Markus Riester

Topic: Microarray-Datenbank höherer Eukaryonten mit Anbindung an Mayday
Supervisor: J. Dietzsch/K. Nieselt
Author: Stephan Symons

Topic: Erstellung einer Graphischen Benutzeroberfläche und von Sequenzclusterprogrammen im Rahmen des Projekts PhyloPipe
Supervisor: S. Steigele/K. Nieselt
Author: Ralf Eilbracht

Topic: PhyloPipe: Pipeline zur automatischen Rekonstruktion von Phylogenien
Supervisor: S. Steigele/K. Nieselt
Author: Jan Philipp Meier-Kolthoff

Topic: Anbindung von R in Mayday
Supervisor: J. Dietzsch/K. Nieselt
Author: Matthias Zschunke

Topic: Detektion und Annotation von Repeats in Pristionchus pacificus
Supervisor: S. Steigele/K. Nieselt
Author: Alexander Breit

Topic: Integration von Quartett-Mapping in jSPLITS
Supervisor: K. Nieselt/T. Klöpper
Author: Kristoffer Forslund

Topic: Visualisierung von geclusterten Genexpressionsdaten
Supervisor: J. Dietzsch/K. Nieselt
Author: Nils Gehlenborg

Topic: Genomweite in silico Detektion und Annotation von Natürlichen Antisense Transkripten inSaccharomyces cerevisiae
Supervisor: S. Steigele/K. Nieselt
Author: Daniela Eggle

Topic: J-iQMAP: interactive Quartet Mapping in Java
Supervisor: J. Dietzsch/K. Nieselt
Author: Carola Huthmacher

Topic: Integration von VMATCH und RepeatMasker
Supervisor: S. Steigele/K. Nieselt
Author: Kirstin Weber

Topic: Detektion von Motiven in regulatorischen Regionen mit Signaltransformationen
Supervisor: J. Dietzsch/K. Nieselt
Author: Marc Röttig