Zentrum für Datenverarbeitung (ZDV)

bwForCluster BinAC 2

Der bwForCluster BinAC 2 ist Teil des Umsetzungskonzeptes der Universitäten des Landes Baden-Württemberg für Hochleistungsrechnen (bwHPC) und steht landesweit allen Wissenschaftlern im Bereich Bioinformatik, Astrophysik, Geowissenschaften, Pharmazie und Medizinischer Informatik zur Verfügung. Die Hardware des BinAC 2 wurde optimal auf diese vorgesehene Nutzung abgestimmt, um eine hohe Effizienz der Anwendungen in diesem wissenschaftlichen Gebiet erzielen zu können.

Als Sitz des landesweiten HPC Kompetenzzentrums für Bioinformatik und Astrophysik Baden-Württemberg wird dieser Cluster am Standort Tübingen durch das Zentrum für Datenverarbeitung der Universität Tübingen betrieben und die fachspezifischen Anwendungen im Rahmen des bwHPC-S5 Projektes gezielt unterstützt.

Hardware

Das BinAC 2-System besteht aus insgesamt 252 Rechen- und GPU-Knoten mit unterschiedlichen Hardware-Konfigurationen:

  • 192 Standard-Rechenknoten: jeweils 2 × AMD EPYC Milan Prozessoren (7543 oder 75F3), 64 physische Kerne pro Knoten, 512 GB Arbeitsspeicher und 450 GiB lokaler NVMe-SSD-Speicher.
  • 16 High-Memory-/SMP-Knoten: jeweils 2 × AMD EPYC Milan Prozessoren (7443 oder 75F3), 48 bzw. 64 physische Kerne pro Knoten, 2048 GB Arbeitsspeicher und 14.000 GiB lokaler NVMe-SSD-Speicher.
  • 32 GPU-Knoten: jeweils 2 × AMD EPYC Milan 7543 Prozessoren, 64 physische Kerne, 512 GB Arbeitsspeicher und 450 GiB lokaler NVMe-SSD-Speicher. Jeder Knoten ist mit 2 × NVIDIA A30 GPUs ausgestattet, jeweils mit 24 GB ECC HBM2-Speicher und NVLink.
  • 8 GPU-Knoten: jeweils 2 × AMD EPYC Milan 7543 Prozessoren, 64 physische Kerne, 512 GB Arbeitsspeicher und 14.000 GiB lokaler NVMe-SSD-Speicher. Jeder Knoten ist mit 4 × NVIDIA A100 GPUs ausgestattet, jeweils mit 80 GB ECC HBM2e-Speicher.
  • 4 GPU-Knoten: jeweils 2 × AMD EPYC Milan 9555 Prozessoren, 128 physische Kerne, 1536 GB Arbeitsspeicher und 28.000 GiB lokaler NVMe-SSD-Speicher. Jeder Knoten ist mit 4 × NVIDIA H200 NVL GPUs ausgestattet, jeweils mit 141 GB ECC HBM3e-Speicher und NVLink.

Die Rechenknoten und das parallele Dateisystem sind über ein 100-GbE-Ethernet-Netzwerk verbunden. Zusätzlich sind 84 Standard-Rechenknoten über HDR-100-InfiniBand angebunden. Jobs, die InfiniBand benötigen, können mit der Option --constraint=ib gezielt auf diesen Knoten ausgeführt werden.

Die H200-GPU-Knoten verfügen zusätzlich über HDR-200-InfiniBand neben der 100-GbE-Anbindung.

Als Betriebssystem wird Rocky Linux 9.8 eingesetzt. Als Batch- und Ressourcenmanagementsystem kommt Slurm zum Einsatz. Wissenschaftliche Software und Bibliotheken werden über das Environment-Modules-System bereitgestellt.Module-System 

Hier erfahren Sie mehr:

Zugang

Das Rechnersystem steht auf Antrag allen Wissenschaftlern aus den Bereichen Bioinformatik, Astrophysik und Geowissenschaften in Baden-Württemberg unentgeltlich zur Verfügung.

Der Link zur Anmeldung und Unterstützung ist unten angegeben.

Anmeldung                                                                                          Unterstützung: hpcmaster@uni-tuebingen.de