Algorithms in Bioinformatics

BIOINF1110 Einführung in die Bioinformatik

Veranstaltung BIOINF1110 Einführung in die Bioinformatik
Dozenten Prof. Daniel Huson, Prof. Oliver Kohlbacher, Prof. Michael Krone,
Prof. Andrei Lupas, Prof. Kay Nieselt, Prof. Stephan Ossowski und
Prof. Nico Pfeifer  
Übungen Keine Übungstermine, nur online Abgabe und Korrektur
Ort und Zeit Hörsaal N02, Morgenstelle, Donnertags, 13:15-14h 
Anmeldung Ilias
Prüfungsform Es gibt eine Klausur am Ende des Semesters, die sich an den Übungsaufgaben orientiert
Material Folien in PDF Format, Übungsaufgaben zum Selbststudium
Links Ilias Campus

Diese Veranstaltung vermittelt einen ersten Einblick in die Bioinformatik. Dazu werden in der Vorlesung ausgewählte Anwendungen der Bioinformatik kurz vorgestellt. Perspektivisch wird dabei erläutert, wie die in den ersten beiden Jahren des Bioinformatikstudiums vermittelten Grundlagenkenntnisse dabei zur Anwendung kommen. Die Themen decken grosse Teile Bioinformatik ab, variieren aber, um einen großen Aktualitätsbezug zu haben.

Es gibt wöchentliche Übungsblätter, die über Ilias herausgegeben und abgegeben werden.

Termin

Titel der Vorlesung

Dozent

18.4.

1. Was ist Bioinformatik?

Nieselt

25.4.

 2. Von der DNA zur Datenbank - Sequenzierung & Assemblierung

Huson

2.5.

3. Darwins Erben - Phylogenie und Bäume

Huson

9.5.

4. Designerdrogen – Wirkstoffe aus dem Rechner 

Kohlbacher

16.5.

5. Aus einer Hand voll Erde – Metagenomik

Huson

23.5..

6. Das Mikroskop im Computer – Visualisierung molekularer Strukturen

Krone

6.6.

7. Gut vernetzt hält besser - Analyse biologischer Netzwerke

Nieselt

27.6..

8.  Multi-OMICs - NGS für regulatorische Genetik

Ossowski

4.7..

9. Bioinformatische Methoden im Kampf gegen HIV

Pfeifer

11.7.

10.  Impfen gegen Krebs – Bioinformatik im Impfstoffentwurf

Kohlbacher

18.7.

11.  Die Sprache der Proteine – Evolution konservierter Proteinstrukturen

Lupas

25.7.

Klausur  

 

Wer die Klausur nicht besteht (nicht 50% der Punkte erreicht oder nicht erschienen) hat die Möglichkeit, eine Ersatzklausur zu schreiben, am Freitag, den 30.9. um 9h in Hörsaal 2, Sand 6/7.