Die zentrale Graduiertenakademie ist Teil der zentralen Verwaltung der Universität. Sie ist im Dezernat II - Forschung angesiedelt. Im Rektorat ist der bzw. die Prorektor:In für Forschung und Innovation zuständig. Neben der zentralen Graduiertenakademie gibt es an der Universität Tübingen noch die Sektionen der Graduiertenakademie, die an den Fakultäten verortet sind. Die Fakultäten haben dazu Kontaktpersonen benannt, die mit der Graduiertenakademie in regelmäßigem Austausch stehen. Dadurch ist gewährleistet, dass Bedarfe frühzeitig erkannt und abgestimmt werden. Die Sektionen organisieren teilweise eigene, fachspezifische Qualifizierungsangebote, teilweise überfakultäre Veranstaltungen gemeinsam mit der zentralen Graduiertenakademie. Es gibt die Sektionen "Medizinische Fakultät", "Mathematisch- und Naturwissenschaftliche Fakultät", "Wirtschafts- und Sozialwissenschaftliche Fakultät" und "Geisteswissenschaften", wobei letztere für die Philosophische Fakultät, die Katholisch-Theologische und Evangelisch-Theologische Fakultät zuständig ist. Natürlich können Promovierende von allen Fakultäten und Instituten ohne eigene Sektion die Angebote der Graduiertenakademie in Anspruch nehmen.
