05.12.2025

BioSET – Biomarker-based Spatial co-Expression analysis in Tumor environments

Auf der IEEE VIS 2025 in Wien hatten wir die Gelegenheit, unser Projekt „BioSET –Biomarker-based Spatial co-Expression analysis in Tumor environments“ einem internationalen Fachpublikum vorzustellen. Im Rahmen der Bio+MedVis Challenge haben wir das von uns entwickelte, interaktive Tool zur räumlichen Analyse von Biomarker-Kombinationen einer dreidimensionalen Mikroskopie-Probe präsentiert. Wir sind sehr stolz darauf, dass wir mit dem Award of Excellence für unsere Einreichung ausgezeichnet wurden. Während der Postersession konnten wir zahlreiche anregende Diskussionen führen, und Interessierten unserer Kombination aus volumenbasiertem Rendering, Mesh-Extraktion und der Integration von LLM-gestützter biologischer Interpretation genauer erläutern. Die vielen Gespräche mit Expert*innen aus Visualisierung, Biomedizin und Softwareentwicklung waren äußerst wertvoll und wir nehmen wichtige Impulse für zukünftige Erweiterungen von BioSET mit.

Die Präsentation unseres BioSET-Projekts auf der IEEE VIS 2025 in Wien war eine großartige Erfahrung und wir konnten viele wertvolle Impulse mitnehmen. Der Austausch mit internationalen Expert*innen hat uns darin bestätigt, wie relevant unsere Methode für die Analyse komplexer 3D-Mikroskopie Daten ist. Unser besonderer Dank gilt dem Universitätsbund, der diese Teilnahme überhaupt erst ermöglicht hat.

Sophia Gaupp und Luca Reichmann