Algorithmen der Bioinformatik

BIOINF1110 Einführung in die Bioinformatik

Veranstaltung BIOINF1110 Einführung in die Bioinformatik
Dozenten Prof. Manfred Claassen, Prof. Andreas Dräger, Prof. Daniel Huson, Prof. Oliver Kohlbacher, Prof. Michael KroneProf. Andrei Lupas, Prof. Kay Nieselt, Prof. Stephan OssowskiProf. Nico PfeiferDr. Philipp Thiel und Prof. Nadine Ziemert
Übungen

Wöchentliche Onlineübungen über Ilias.

Übungsleitung: Sascha Patz

Ort und Zeit

Start: 22. April 2021

Diese Veranstaltung findet virtuell statt.

Donnertags, 13:15 - Bereitstellung der Vorlesungsunterlagen.

Für wen? Für BSc Bioinformatik, Informatik oder Medizininformatik, Anmeldung über Ilias
Prüfungsform Es gibt eine Klausur am Ende des Semesters, die sich an den Übungsaufgaben orientiert
Material

Vorlesungen per Zoom oder in MP4 Format, Folien in PDF Format, Übungsaufgaben, auf Ilias

Links Alma Ilias

 

Diese Veranstaltung vermittelt einen ersten Einblick in die Bioinformatik. Dazu werden in der Vorlesung ausgewählte Anwendungen der Bioinformatik kurz vorgestellt. Perspektivisch wird dabei erläutert, wie die in den ersten beiden Jahren des Bioinformatikstudiums vermittelten Grundlagenkenntnisse dabei zur Anwendung kommen. Die Themen decken grosse Teile Bioinformatik ab, variieren aber, um einen großen Aktualitätsbezug zu haben.

Es gibt wöchentliche Übungsfragen, die über Ilias herausgegeben und beantwortet werden.

Es müssen mindestens 50% der Übungspunkte erreicht werden, um zur Klausur zugelassen zu werden. 

Die Klausur gilt als bestanden, wenn mindestens 50% der Klausurpunkte erzielt wurden. Die Klausur findet online über Ilias statt.

Termin Titel der Vorlesung Dozent
22.04. 1. Was ist Bioinformatik? Nieselt
29.04. 2. Von der DNA zur Datenbank - Sequenzierung & Assemblierung Huson
06.05. 3. Designerdrogen – Wirkstoffe aus dem Rechner  Thiel
20.05. 4. Wie Stoffwechselmodelle potentielle Angriffsziele gegen SARS-CoV-2 vorhersagen Dräger
10.06. 5. Das Mikroskop im Computer – Visualisierung molekularer Strukturen Krone
17.06. 6. Der Teufel steckt im Detail - Methoden zur Analyse von einzelnen Zellen Claassen
24.06. 7.Genomeanalyse in der klinischen Diagonostik Ossowski
01.07. 8. Aus einer Hand voll Erde – Mikrobiomanalyse Huson
08.07. 9. Impfen gegen Krebs – Bioinformatik im Impfstoffentwurf Kohlbacher
15.07. 10.  Anwendung der Bioinformatik bei der Suche nach neuen Antibiotika Ziemert
22.07. 11.  Die Sprache der Proteine – Evolution konservierter Proteinstrukturen Lupas

29.07.

Online Klausur

 

Wer zur Klausur zugelassen wurde, aber die Klausur nicht bestanden hat (weniger als 50% der Punkte erreicht, oder nicht erschienen) kann an einer Nachklausur am 28.9. teilnehmen.