Algorithmen der Bioinformatik

Willkommen im Labor für Algorithmen in der Bioinformatik

Das Hauptaugenmerk unseres Labors liegt auf der Entwicklung neuer und fortschrittlicher Algorithmen für die Bioinformatik. Hier ist eine kurze Liste unserer aktuellen Forschungsschwerpunkte:

  • Microbiomanalyse und -simulation
  • Long-Read-Analyse
  • Phylogenetische Netzwerke und Bäume
  • Modelle, Algorithmen, Software und Komplexität

Weitere Einzelheiten finden Sie im Abschnitt Forschung, in unseren Veröffentlichungen und in unserer Software.

Neue Publikationen

Rajveer Singh, Shivani Chandel, Arijit Ghosh, Anupam Gautam, Daniel H. Huson, V. Ravichandiran, Dipanjan Ghosh, Easy efficient HDR-based targeted knock-in in Saccharomyces cerevisiae genome using CRISPR-Cas9 system, Bioengineered, 2023

Wenhuan Zeng, Anupam Gautam, Daniel H. Huson, MuLan-Methyl - Multiple Transformer-based Language Models for Accurate DNA Methylation Prediction, preprint bioRxiv, 2023

Anupam Gautam, Wenhuan Zeng, Daniel Huson Megan Server: facilitating interactive access to metagenomic data on a server, Preprint bioRxiv, 2022

Wenhuan Zeng, Anupam Gautam, Daniel H Huson, DeepToA: an ensemble deep-learning approach to predicting the theater of activity of a microbiome, Bioinformatics, 2022;, btac584. 

 

 

 

 

 

 

 

 

Aktuelle Neuigkeiten

Wir sind einen Monat Mitveranstalter von Workshops über Phylogenetik an der NUS in Singapur, bitte nehmen Sie teil. Mathematics of Evolution-Phylogenetic Trees and Networks - Institute for Mathematical Science (04 Sep 2023–29 Sep 2023)

Robin Gerlach is visiting the group September 2022 for a year. He is a professor in the Department of Chemical and Biological Engineering at Montana State University-Bozeman (MSU).