Algorithmen der Bioinformatik

Einführung in die Bioinformatik

Veranstaltung Einführung in die Bioinformatik, SoSe 2014
Dozenten Prof. Daniel Huson, Prof. Oliver Kohlbacher, Prof. Andrei Lupas and Dr. Kay Nieselt
Übungen Joachim Fritscher (Freiwillige Abgabe per email an. joachim.fritscher at student.uni-tuebingen.de)
Ort und Zeit Hörsaal N1, Morgenstelle, Donnerstags, 13:15-14:00
Modul BSc Bioinformatik, Modul Ringveranstaltung, 2 LP
Prüfungsform Es gibt eine Klausur am Ende des Semesters, die sich an den Übungsaufgaben orientiert
Material Folien in PDF-Format, Übungsaufgaben zum Selbststudium
Campus http://campus.verwaltung.uni-tuebingen.de/20141d102846

Diese Veranstaltung vermittelt einen ersten Einblick in die Bioinformatik. Dazu werden in der Vorlesung ausgewählte Anwendungen der Bioinformatik kurz vorgestellt. Perspektivisch wird dabei erläutert, wie die in den ersten beiden Jahren des Bioinformatikstudiums vermittelten Grundlagenkenntnisse dabei zur Anwendung kommen. Die Themen decken grosse Teile Bioinformatik ab, variieren aber, um einen großen Aktualitätsbezug zu haben.

Thema (Reihenfolge kann sich noch ändern)AufgabenTerminDozent
1. Was ist Bioinformatik?Blatt 110.4Nieselt
2. Designerdrogen - Wirkstoffe aus dem RechnerBlatt 217.4Kohlbacher
3. Von der DNA zur Datenbank - Sequenzierung & AssemblierungBlatt 324.4Huson
4. Designerdrogen aus dem RechnerBlatt 48.5Kohlbacher

5. It's hip to Chip - von Microarrays zu personalisierter Medizin

Blatt 515.5Nieselt
6. Darwins Erben - Phylogenie und BäumeBlatt 622.5Huson
7. Impfen gegen Krebs: Bioninformatik im Impfstoffentwurf5.6Kohlbacher
8. Gut vernetzt hält besser: Analyse biologischer Netzwerke26.6Kohlbacher
9. Aus einer Hand voll Erde - Metagenomik3.7Huson
10. Virus-Evolution und Populationsgenetik10.7??
11. Die Sprache der Proteine - Evolution konservierter Proteinstrukturen17.7Lupas
Klausur in N5 (13-14h)24.7



Wer die Klausur nicht besteht (nicht 50% der Punkte erreicht oder nicht erschienen) hat die Möglichkeit, eine Ersatzklausur am 2.10. um 10h in A301, Sand 14, zu schreiben.