Algorithmen der Bioinformatik

Grundlagen der Bioinformatik

Dozenten Prof. Daniel Huson und Benjamin Buchfink
Vorlesungstermine Montas 10:15-12h, Mittwochs 10:15-12h, A301
Übungsgruppen TBA
Modulzugehörigkeit BSc Bioinformatik, Grundlagen der Bioinformatik; BSc Informatik, Wahlpflichtmodul Informatik
Notengebung Die Note ergibt sich wie folgt: 70 % aus den Ergebnissen der beiden Klausuren, 30 % für das Lösen und Vorrechnen von übungsaufgaben
Anwesenheitspflicht Es besteht eine Anwesenheitspflicht für Übungsgruppen
Sprache Deutsch
Ilias https://ovidius.uni-tuebingen.de/ilias3/goto.php?target=crs_710549&client_id=pr02
Campus http://campus.verwaltung.uni-tuebingen.de/20141d102844

Inhalt und Skript:

In der Vorlesung "Grundlagen der Bioinformatik" werden wichige Grundprobleme derbioinformatik vorgestellt. Es wird zu jeder Vorlesung ein Skript verteilt. Skript und Übungsblatter sind über die Ilias Webseite der Vorlesung abrufbar.

Hier ist der vorläufige Plan für die Vorlesung.

DatumThemaAufgaben
7.4.1. General introduction (inkl.Festlegung und Einteilung der Übungsgruppen)
9.4.2. Pairwise alignment
14.4.Fortsetzung
16.4.3. Database sequence search
21.4.Fortsetzung
23.4.4. Multiple sequence alignment
28.4.Fortsetzung
30.4.5. Phylogeny
5.5Fortsetzung
7.5.Fortsetzung
12.5.6. Population genetics
14.5.Fortsetzung
19.5.7. Sequencing and assembly
21.5.

Klausur 1 (über Kapitel 1-6)

Nachname A-K: A301, Sand 13

Nachname L-Z: Hörsaal 1, Sand 6/7

26.5.Fortsetzung
28.58. Protein secondary structure
2.6.Forsetzung
4.6.9. RNA secondary structure
16.6.10. Protein tertiary structure
18.6.Fortsetzung
23.6.11. Machine learning
25.6.Fortsetzung
30.6.12. Gene finding
2.7.13. Human genomics
7.7.Forsetzung
9.7.14. Metagenomics
14.7Fortsetzung
16.7.Klausur 2 (über Kapitel 7-14)