Abgeschlossene Bachelorarbeiten

2024

Thema: Die Überführung der Pipeline TSS-Captur als Webanwendung zur erleichterten Charakterisierung unbekannter RNA-Transkripte
BetreuerIn: Kay Nieselt/Mathias Witte Paz
BearbeiterIn: Thomas Vogel

Thema: Taxonomische Klassifikation bakterieller DNS-Sequenzen auf Spezieslevel mit maschinellem Lernen
BetreuerIn: Kay Nieselt/Wolfgang Fühl/Susanne Zabel
BearbeiterIn: Kevin Bertoletti

Thema: Improved methods for the analysis of multi-mapping RNA-Seq reads in rRNA depletion quality control
BetreuerIn: Kay Nieselt/Theresa Harbig
BearbeiterIn: Sarina Stadler

Thema: Improving the characterization of the 5’ and 3’ regions in TSS-Captur
BetreuerIn: Kay Nieselt/Mathias Witte Paz
BearbeiterIn: Tom Wolf

Thema: Genomweite Integration von DNA- und RNA-Daten von Covid19-Patienten
BetreuerIn: Kay Nieselt 
BearbeiterIn: Martin Kahabka

Thema:  Genome-wide characterization of lipoproteins in Corynebacteria
BetreuerIn: Kay Nieselt/Mathias Witte Paz
BearbeiterIn: Daniel Kocher

2023

Thema: Konzeption einer Sequenzdatenbank der Bakterien zur Detektion von Außenmembranproteinen
BetreuerIn: Kay Nieselt/Simon Hackl
BearbeiterIn: Fabian Sperber

Thema: Anwendung von Methoden des unüberwachten maschinellen Lernens zur Charakterisierung von Genotypdaten
Betreuerin: Kay Nieselt/Simon Hackl
Bearbeiterin: Leonard Bumiller

Thema: Improving CLASSICO
Betreuerin: Kay Nieselt/Mathias Witte Paz
Bearbeiterin: Eileen Kränzle

2022

Thema: Genotypen in Treponema pallidum
Betreuerin: Kay Nieselt/Simon Hackl
Bearbeiterin: Jonathan Nemitz

Thema: Ein interaktives Webinterface für TSSpredator
Betreuerin: Kay Nieselt/Mathias Witte Paz
Bearbeiterin: Valerie Bouillon

Thema: Verbesserung von Genomannotationen mit Hilfe von Transkriptom- und Proteomdaten
Betreuerin: Kay Nieselt/Caroline Jachmann/Mathias Witte Paz
Bearbeiterin: Moritz Christ

Thema: Vergleich von Genomvarianten bei unterschiedlichen Assembly- und SNP-Calling-Strategien
Betreuerin: Kay Nieselt/Theresa Harbig
Bearbeiterin: Mareen Hundt

Thema: Dimension reduction in Mayday 2.0 with applications to multi-omics data
BetreuerIn: Kay Nieselt/Susanne Zabel
BearbeiterIn: Jutta Seth

2021

Thema: Co-appearances of genes in microbiomes
BetreuerIn: Kay Nieselt/Susanne Zabel
BearbeiterIn: Johannes Hölle

Thema: Data mining for conditions which influence the echolocation behavior of forgaging Rhinopoma
BetreuerIn: Kay Nieselt/Prof. Schnitzler
BearbeiterIn: Marc Krause

Thema: Integration of statistical methods into Evidente
BetreuerIn: Kay Nieselt/Theresa Harbig
BearbeiterIn: Sophie Pesch

2020

Thema: Rekonstruktion und Vergleich von Transkriptensequenzen in Streptomyces coelicolor Zeitserien
BetreuerIn: Kay Nieselt
BearbeiterIn: Franziska Daumüller

Thema: Erweiterte Funktionalitäten für EAGER
BetreuerIn: Kay Nieselt
BearbeiterIn: Lennart Krohn

Thema: Detection of DNA contamination in RNA-seq data
BetreuerIn: Kay Nieselt
BearbeiterIn: Henry Böhm

Thema: GenomeRing - eine Standalone Java FX-Anwendung
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Eyyub Bag

2019

Thema: Eine vergleichende Studie von Microarray- und RNASeq-Daten
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Nadine Schacherer

Thema: Detektion differentiell exprimierter Gene in Zeitreihendaten am Beispiel Streptomyces coelicolor
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Hannah Frank

Thema: Gene regulatory networks from time series expression data in Streptomyces coelicolor
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Marvin Döbel

Thema: Differential gene expression in different healthy human brain regions using CAGE-seq data
BetreuerIn: K. Nieselt/A. Hennig
BearbeiterIn: An Jiahui

Thema: Indexing the SuperGenome
BetreuerIn: K. Nieselt/A. Hennig
BearbeiterIn: Mauro Di Girolamo

Thema: Comparison of microarray and RNA-seq derived transcriptomes in Streptomyces coelicolor
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Kilian Bunge

 

2018

Thema: EVIDENTE – A Visual Analytics Tool for Data Enrichment in Phylogenetic Trees
BetreuerIn: A. Seitz/K. Nieselt
BearbeiterIn: Mathias Alexander Witte Paz

Thema: Effiziente Identifikation von Claden-spezifischen SNPs
BetreuerIn: A. Seitz/K. Nieselt
BearbeiterIn: Katrin Fischer

Thema: Erstellung eines Web User Interface für die Vorhersage von Transkriptionsstartpunkten aus dRNA-seq-Daten
BetreuerIn: S. Fillinger/K. Nieselt
BearbeiterIn: Julian Müller

2017

Thema: Implementierung eines Tools zur Maskierung repetitiver Sequenzen in Genomen
BetreuerIn: A. Seitz/K. Nieselt
BearbeiterIn: Friederike Hanssen

Thema: Genomic haplotype phasing and motif searching around recomination hotspots in stickleback fish
BetreuerIn: F. Jones/K. Nieselt
BearbeiterIn: Marcus Lahm

2016

Thema: Evaluierungstoolbox zur Assemblierung kurzer Sequenzfragmente altertümlicher, metagenomischer Proben
BetreuerIn: A. Seitz/K. Nieselt
BearbeiterIn: Lars-Christian Archauer

Thema: Funktions- und strukturbasierte Analyse genetischer Varianten mit Fokus auf klinische Phänotypen
BetreuerIn: A. Seitz/F. Battke
BearbeiterIn: Tobias Koch

Thema: Funktionale Annotation von genetischen Varianten mit Fokus auf klinische Phänotypen
BetreuerIn: A. Seitz/F. Battke
BearbeiterIn: Jonas Kübler

2015

Thema: PanGeeDB: A SuperGenome-based database for Pan-genomes
BetreuerIn: A. Hennig/K. Nieselt
BearbeiterIn: Marie Gauder

Thema: Genexpressionsstudien in Streptomyces coelicolor mit Hilfe von Mayday
BetreuerIn: A. Hennig/K. Nieselt
BearbeiterIn: Alexander Stoppel

2014

Thema: Implementierung einer Toolbox zur automatisierten Reportgenerierung innerhalb der EAGER Pipeline
BetreuerIn: K. Nieselt/A. Peltzer
BearbeiterIn: Maximilian Hanussek

Thema: Toolbox zur Erstellung von Contamination Reports innerhalb der EAGER Pipeline
BetreuerIn: K. Nieselt/A. Peltzer
BearbeiterIn: Christopher Jürges

Thema: The expression landscape of monozygotic twins
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Alicia Owen

Thema: Collact.me Android App Development
BetreuerIn: A. C. Polatkan
BearbeiterIn: Nicolai Wahn

Thema: Tweet content mining and visualization of user reputation scores for Collact.me framework
BetreuerIn: A. C. Polatkan
BearbeiterIn: Philipp Weber

Thema: TOPAS – Toolkit for Processing and Annotating Sequence Data
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Simon Heumos

2013

Thema: Bigramm-Alignierung und ihre Anwendung in der historischen Linguistik
BetreuerIn: S. Steiner/C. Höner zu Siederdissen/K. Nieselt
BearbeiterIn: Nancy Retzlaff

Thema: Interaktives visuelles Clustering
BetreuerIn: G. Jäger
BearbeiterIn: Eugen Netz

Thema: Design and implementation of administration and enrichment tools for the Collaborative Social Network: Collact
BetreuerIn: A. C. Polatikan
BearbeiterIn: Martin Lang

Thema: Mikrogravitationsabhänige Genexpression in Arabidopsis thaliana
BetreuerIn: K. Nieselt/G. Jäger
BearbeiterIn: Nina Spirer

2012

Thema: Parallelisierung des QT-Clusterings in Mayday
BetreuerIn: G. Jäger/K. Nieselt
BearbeiterIn: Sebastian Nagel

Thema: Design und Implementierung einer REST-API für ein Soziales Netzwerk
BetreuerIn: A. C. Polatkan/K. Nieselt
BearbeiterIn: Patrick Haug

Thema: Extrahierung und Klassifizierung von Microblogging-Inhalten mit Anwendung auf bioinformatische Themen
BetreuerIn: A. C. Polatkan/K. Nieselt
BearbeiterIn: Jonas Begemann

2011

Thema: Genomweite Expressionsanalyse mesenchymaler Stammzellen
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. Aicher
BearbeiterIn: André Hennig

Thema: Transcript Count Statistics for Expression Studies from Second-Generation Sequencing Data
BetreuerIn: F. Battke/K. Nieselt
BearbeiterIn: Dilek Tuncbilek

Thema: Interaktive Visualisierung von systembiologischen Daten
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Symons
BearbeiterIn: Matthias Munz

Thema: Vergleich von Vorhersage-Verfahren für non-coding RNAs in Bakterien
BetreuerIn: K. Nieselt/A. Herbig
BearbeiterIn: Philipp Kirstahler

Thema: Sequence based filtering of RNA-RNA interaction candidates
BetreuerIn: K. Nieselt/A. Herbig
BearbeiterIn: Julian Gutekunst

Thema: Fast alignment methods of RNA-sequencing data
BetreuerIn: K. Nieselt/F. Battke
BearbeiterIn: Björn Petri

2010

Thema: Detecting and modelling time shifts in microarray time series data applying Gaussian processes
BetreuerIn: K. Nieselt/O. Stegle (MPI)
BearbeiterIn: Max Zwießele

Thema: Experimentelle Annotation der Transkriptionslandschaften von Candida albicans und Candida dubliniensis
BetreuerIn: K. Nieselt/K. Sohn (GB)
BearbeiterIn: Philip Stevens

Thema: Automatisierung von Mayday mit Java Scripta>
BetreuerIn: K. Nieselt/F. Battke
BearbeiterIn: Tobias Ries

2009

Thema: Statistical Data Analysis for the Detection of Differentially Expressed Genes
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Symons
BearbeiterIn: Sina Beier

Thema: Motif finding in Mayday
BetreuerIn: K. Nieselt/F. Battke
BearbeiterIn: Frederik Weber

2008

Thema: QT-Clustering für Mayday
BetreuerIn: K. Nieselt/J. Dietzsch
BearbeiterIn: Günter Jäger

Thema: Erstellung eines effizienten Visualisierungs-Frameworks für Mayday
BetreuerIn: K. Nieselt/F. Battke
BearbeiterIn: Philipp Bruns

Thema: Regulatorische Netzwerke mit Association-Mining
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Symons
BearbeiterIn: Christian Sieber

Thema: Datenbank und Analyse von Immunologie-Expressionsdaten
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Symons
BearbeiterIn: Steffen Sass

Datenschutzeinstellungen

Auf unserer Webseite werden Cookies verwendet. Einige davon werden zwingend benötigt, während es uns andere ermöglichen, Ihre Nutzererfahrung auf unserer Webseite zu verbessern. Ihre getroffenen Einstellungen können jederzeit bearbeitet werden.

oder

Essentiell

in2code

Videos

in2code
YouTube
Google