Abgeschlossene Masterarbeiten

2019

Thema: How bitter is Lactococcus lactus? An integrative genomic approach to identify genes of bitterness
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. H. Schmidt (Stuttgart)
BearbeiterIn: Robin Harmening

Thema: Genome architecture-aware mapping using the SuperGenome
BetreuerIn: K. Nieselt/N. Ziemert
BearbeiterIn: Friederike Hanssen

 

 

2018

Thema: Visualization approaches for tumor evolution in liquid biopsy data
BetreuerIn: N. Gehlenborg (extern, Medical Harvard)/K. Nieselt
BearbeiterIn: Theresa Harbig

Thema: Representation of ME-models in SBML
BetreuerIn: O. Kohlbacher/K. Nieselt
BearbeiterIn: Marc Alexander Voigt

Thema: Single Cell RNA-seq for Plant Protoplasts
BetreuerIn: M. Timmermans/K. Nieselt
BearbeiterIn: Chong Lu

Thema: Application of NGS to the identification of antibiotic resistant bacteria
BetreuerIn: Prof. K. Musser (Wadsworth Center, Albany, USA)/K. Nieselt
BearbeiterIn: Wolfgang Haas

Thema: Large-scale Pangenomics
BetreuerIn: M. Pop, UMD (extern)/K. Nieselt
BearbeiterIn: Nils Oliver Schliebs

 

2017

Thema: Integrative characterization of the house dust mite murine asthma model
BetreuerIn: K. Nieselt/Boehringer (extern)
BearbeiterIn: Kevin Menden

Thema: Studying Parasite-Host interaction
BetreuerIn: K. Nieselt/T. Dijkstra
BearbeiterIn: Fabian Mörtter

Thema: Phylogenetic reconstruction of genomes from ancient DNA and modern DNA
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. Fischer (Greifswald)
BearbeiterIn: Veronika Böttcher

2016

Thema: Methods for time-series differential gene expression analysis
BetreuerIn: K. Nieselt/R. Neher
BearbeiterIn: Adrian Geißler

Thema: Metabarcoding workflows for Biodiversity assessment of belowground fungal communities
BetreuerIn: K. Nieselt/N. Ziemert
BearbeiterIn: Max Emil Schön

Thema: TSSpredator 2.0: Improved and enhanced transcription start site prediction
BetreuerIn: K. Nieselt/A. Herbig (J. Krause)
BearbeiterIn: Sven Fillinger

Thema: Evaluation and Extension of PASSAGE – Parallel Sequencing Systems for the Analysis of Gene Expression
BetreuerIn: K. Nieselt/H. Köhler
BearbeiterIn: Lucia Vedder

2015

Thema: Testing framework and improved algorithms for ancient genome reconstruction
BetreuerIn: K.Nieselt/J. Krause
BearbeiterIn: Judith Neukamm

2014

Thema: StreptoExpress – genomewide expression analyses of Streptomyces coelicolor
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Natalya Sabirova

Thema: From the SuperGenome to the Pangenome of Bacteria
BetreuerIn: K. Nieselt/F. Götz
BearbeiterIn: André Hennig

2013

Thema: Bioprocess Data Modelling of Chinese Hamster Ovary Cells
BetreuerIn: K. Nieselt/O. Kohlbacher
BearbeiterIn: Julia Söllner

Thema: Efficient algorithms for Ancient Human Genome Reconstruction
BetreuerIn: K. Nieselt/J. Krause
BearbeiterIn: Alexander Peltzer

Thema: The SuperGenome of Staphylococcus aureus   
BetreuerIn: A. Herbig/K. Nieselt
BearbeiterIn: Linus Backert

Thema: Algorithms for the assembly of ancient genomes
BetreuerIn: K. Nieselt/J. Krause
BearbeiterIn: Volodymyr Piven

Thema: A new very fast mapping algorithm based on sorting
BetreuerIn: K. Nieselt/A. Herbig
BearbeiterIn: Jörg Peter

2012

Thema: Prediction and Systematic Comparison of Non-Coding RNAs in the Bacteria Kingdom
BetreuerIn: A. Herbig/K. Nieselt
BearbeiterIn: Andreas Friedrich

Thema: The history and evolution of SNPs in Yersinia pestis
BetreuerIn: K. Nieselt/J. Krause
BearbeiterIn: Philip Stevens

Thema: Statistics with confidence in comparative metagenomics
BetreuerIn: K. Nieselt/D. Huson
BearbeiterIn: Max Schubach

Thema: Metagenomic Pathway Analysis
BetreuerIn: K. Nieselt/D. Huson
BearbeiterIn: Tim Scheurenbrand

2011

Thema: A dynamic model of metabolism in Enterococcus faecalis
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. P. Wills (NZ)
BearbeiterIn: Markus List

2010

Thema: 3D-Visualization Analytics for Transcriptomic Data
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. G. Scheuermann
BearbeiterIn: Günter Jäger

2008

Thema: Automated Extraction of Variation Mentionas from Literature Sources and Mapping to a unique Database Identifier
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. P. M. Hofmann-Apitius
BearbeiterIn: Philippe Thomas

2007

Thema: Predition of tissue specific enhancers in Caenorhabditis elegans
BetreuerIn: K. Nieselt/R. Sommer/C. Dieterich
BearbeiterIn: Philipp Drewe