Abgeschlossene Masterarbeiten

2024

Thema: Visual Analytics to understanding aminoglycoside resistance in Escherichia coli
BetreuerIn: Kay Nieselt / Ana Rita Brochado / Simon Hackl
Bearbeiterin: Friederike Moroff

Thema: SeaVis: Seaweed Expression Atlas Visualization Tool for Gene Expression of Algae
BetreuerIn: Kay Nieselt / Susana Coelho / Simon Hackl / Theresa Harbig
Bearbeiterin: Carmen Gil Bredehöft

Thema: Uncertainty estimation of ancient genomic data and their low-dimensional representations
BetreuerIn: Kay Nieselt / Cosimo Posth / Susanne Zabel
Bearbeiter: Samira Breitling

Thema: CLINT: Clinical integrative genomics and transcriptomics analyses with application to breast cancer data from blood
BetreuerIn: Kay Nieselt / Olaf Riess
Bearbeiter: Daniel Giesel

Thema: CLINT: Clinical integrative genomics and transcriptomics analyses with application to COVID-19 data
BetreuerIn: Kay Nieselt / Olaf Riess
Bearbeiter: Sebastian Meyer 

2023

Thema: Improving the reconstruction of very ancient mitochondrial genomes from non-human organisms
BetreuerIn: Kay Nieselt/Cosimo Posth/Mathias Witte Paz
Bearbeiterin: Meret Häusler

Thema: Interpretation of Neural Network Classifiers using Rule-based Models
BetreuerIn: Kay Nieselt/Jan Komorowski
BearbeiterIn: Mark Melzer

Thema: Applied Machine Learning for predicting metal binding sites in proteins
BetreuerIn: Kay Nieselt/Tjeerd Dijkstra/Wolfgang Fuhl/Caroline Jachmann
BearbeiterIn: Gizem Alsahan

Thema: Applying Shneiderman’s mantra to Evidente: Enhance zooming and aggregation for large taxonomic data
BetreuerIn: Kay Nieselt/Daniel Huson/Mathias Witte Paz
BearbeiterIn: Dolores Varga

2022

Thema: Pipeline for the computational prediction of antibody targets
BetreuerIn: Kay Nieselt/Samuel Wagner/Simon Hackl
BearbeiterIn: Majd Hammour

Thema: Comparative modeling of Treponema pallidum variable protein regions
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Hackl
BearbeiterIn: Jascha Henseler

Thema: Computational prediction of the 3' end of bacterial transcripts
BetreuerIn: K. Nieselt/C. Wolz
BearbeiterIn: Camill Kaipf

Thema: The OMPeome of Treponema pallidum
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Simon Hackl

2021

Thema: Liver - adipose tissue cross-talk in obesity and Non-alcoholic Fatty Liver Disease (NAFLD) inferred by RNA-Seq data
BetreuerIn: K. Nieselt/M. Claassen
BearbeiterIn: Marvin Döbel

Thema: The manifold insights gained from TSS sequencing data analysed with TSSpredator and other computational methods
BetreuerIn: K. Nieselt/H. Groß
BearbeiterIn: Dilek Tuncbilek-Dere

Thema: From TSS prediction to transcriptome characterization
BetreuerIn: K. Nieselt/H. Groß
BearbeiterIn: Mathias Witte Paz

Thema: PhyloBlast
BetreuerIn: K. Nieselt/F. Götz
BearbeiterIn: Jennifer Müller

Thema: Comparison of expression conservation of orthologs and paralogs
BetreuerIn: K. Nieselt/N. Ziemert
BearbeiterIn: Huang Chin-Hua

Thema: Integrative Transcriptomics- and Proteomics Visualization
BetreuerIn: K. Nieselt/M. Krone
BearbeiterIn: Julian Fratte

Thema: Identification and distribution of Siderophore receptor genes in the bacterial kingdom
BetreuerIn: K. Nieselt/S. Heilbronner
BearbeiterIn: Gordon Armstrong

2020

Thema: Using dRNA-seq to identify a non-clustered glycosyltransferase, essential for the production of brasilicardin A in Nocardia terpenica
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. H. Groß
BearbeiterIn: Tobias Schwarz

2019

Thema: How bitter is Lactococcus lactus? An integrative genomic approach to identify genes of bitterness
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. H. Schmidt (Stuttgart)
BearbeiterIn: Robin Harmening

Thema: Genome architecture-aware mapping using the SuperGenome
BetreuerIn: K. Nieselt/N. Ziemert
BearbeiterIn: Friederike Hanssen

2018

Thema: Visualization approaches for tumor evolution in liquid biopsy data
BetreuerIn: N. Gehlenborg (extern, Medical Harvard)/K. Nieselt
BearbeiterIn: Theresa Harbig

Thema: Representation of ME-models in SBML
BetreuerIn: O. Kohlbacher/K. Nieselt
BearbeiterIn: Marc Alexander Voigt

Thema: Single Cell RNA-seq for Plant Protoplasts
BetreuerIn: M. Timmermans/K. Nieselt
BearbeiterIn: Chong Lu

Thema: Application of NGS to the identification of antibiotic resistant bacteria
BetreuerIn: Prof. K. Musser (Wadsworth Center, Albany, USA)/K. Nieselt
BearbeiterIn: Wolfgang Haas

Thema: Large-scale Pangenomics
BetreuerIn: M. Pop, UMD (extern)/K. Nieselt
BearbeiterIn: Nils Oliver Schliebs

2017

Thema: Integrative characterization of the house dust mite murine asthma model
BetreuerIn: K. Nieselt/Boehringer (extern)
BearbeiterIn: Kevin Menden

Thema: Studying Parasite-Host interaction
BetreuerIn: K. Nieselt/T. Dijkstra
BearbeiterIn: Fabian Mörtter

Thema: Phylogenetic reconstruction of genomes from ancient DNA and modern DNA
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. Fischer (Greifswald)
BearbeiterIn: Veronika Böttcher

2016

Thema: Methods for time-series differential gene expression analysis
BetreuerIn: K. Nieselt/R. Neher
BearbeiterIn: Adrian Geißler

Thema: Metabarcoding workflows for Biodiversity assessment of belowground fungal communities
BetreuerIn: K. Nieselt/N. Ziemert
BearbeiterIn: Max Emil Schön

Thema: TSSpredator 2.0: Improved and enhanced transcription start site prediction
BetreuerIn: K. Nieselt/A. Herbig (J. Krause)
BearbeiterIn: Sven Fillinger

Thema: Evaluation and Extension of PASSAGE – Parallel Sequencing Systems for the Analysis of Gene Expression
BetreuerIn: K. Nieselt/H. Köhler
BearbeiterIn: Lucia Vedder

2015

Thema: Testing framework and improved algorithms for ancient genome reconstruction
BetreuerIn: K.Nieselt/J. Krause
BearbeiterIn: Judith Neukamm

2014

Thema: StreptoExpress – genomewide expression analyses of Streptomyces coelicolor
BetreuerIn: K. Nieselt
BearbeiterIn: Natalya Sabirova

Thema: From the SuperGenome to the Pangenome of Bacteria
BetreuerIn: K. Nieselt/F. Götz
BearbeiterIn: André Hennig

2013

Thema: Bioprocess Data Modelling of Chinese Hamster Ovary Cells
BetreuerIn: K. Nieselt/O. Kohlbacher
BearbeiterIn: Julia Söllner

Thema: Efficient algorithms for Ancient Human Genome Reconstruction
BetreuerIn: K. Nieselt/J. Krause
BearbeiterIn: Alexander Peltzer

Thema: The SuperGenome of Staphylococcus aureus   
BetreuerIn: A. Herbig/K. Nieselt
BearbeiterIn: Linus Backert

Thema: Algorithms for the assembly of ancient genomes
BetreuerIn: K. Nieselt/J. Krause
BearbeiterIn: Volodymyr Piven

Thema: A new very fast mapping algorithm based on sorting
BetreuerIn: K. Nieselt/A. Herbig
BearbeiterIn: Jörg Peter

2012

Thema: Prediction and Systematic Comparison of Non-Coding RNAs in the Bacteria Kingdom
BetreuerIn: A. Herbig/K. Nieselt
BearbeiterIn: Andreas Friedrich

Thema: The history and evolution of SNPs in Yersinia pestis
BetreuerIn: K. Nieselt/J. Krause
BearbeiterIn: Philip Stevens

Thema: Statistics with confidence in comparative metagenomics
BetreuerIn: K. Nieselt/D. Huson
BearbeiterIn: Max Schubach

Thema: Metagenomic Pathway Analysis
BetreuerIn: K. Nieselt/D. Huson
BearbeiterIn: Tim Scheurenbrand

2011

Thema: A dynamic model of metabolism in Enterococcus faecalis
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. P. Wills (NZ)
BearbeiterIn: Markus List

2010

Thema: 3D-Visualization Analytics for Transcriptomic Data
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. G. Scheuermann
BearbeiterIn: Günter Jäger

2008

Thema: Automated Extraction of Variation Mentionas from Literature Sources and Mapping to a unique Database Identifier
BetreuerIn: K. Nieselt/Prof. P. M. Hofmann-Apitius
BearbeiterIn: Philippe Thomas

2007

Thema: Predition of tissue specific enhancers in Caenorhabditis elegans
BetreuerIn: K. Nieselt/R. Sommer/C. Dieterich
BearbeiterIn: Philipp Drewe

Datenschutzeinstellungen

Auf unserer Webseite werden Cookies verwendet. Einige davon werden zwingend benötigt, während es uns andere ermöglichen, Ihre Nutzererfahrung auf unserer Webseite zu verbessern. Ihre getroffenen Einstellungen können jederzeit bearbeitet werden.

oder

Essentiell

in2code

Videos

in2code
YouTube
Google