22.08.2022

Erste genom-skalige Rekonstruktion von Klebsiella penumoniae HS11286

Meike Lips erstellt in ihrer Bachelorarbeit das erste Modell zum HS11286-Stamm von K. pneumoniae.

Klebsiella pneumoniae ist ein gramnegatives, fakultativ anaerobes Bakterium aus der Enterobacteriaceae-Familie. Es wächst auf verschiedenen menschlichen Schleimhäuten, wie der Nase und auch im Darm. Klebsiella pneumoniae gehört zu den sogenannten ESKAPE-Pathogenen (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa und Enterobacter spp.). Aufgrund der zunehmenden Entwicklung von Antibiotikaresistenzen dieser Gruppe von Pathogenen stellen diese nicht nur eine Gefahr für Personen mit geschwächten Immunsystemen dar, sondern auch für gesunde Individuen. So wurde die Rekonstruktion eines genom-skaligen Modelles für Klebsiella penumoniae HS11286 dadurch motiviert, ein tieferes Verständnis für den Stoffwechsel des Pathogens zu erhalten, sowie eine hilfreiches Forschungswerkzeug zu bauen, welches in der Entwicklung neuer Behandlungsmethoden unterstützend wirken kann. Das Modell wurde auf verschiedene Arten validiert, zum einen durch die Simulation verschiedener Wachstumsraten auf experimentell bestimmten Medienzusammensetzungen, wie dem synthetischen nasalen Medium SNM3 und zum anderen durch die Vorhersage von essenziellen Genen.