Alumni

Ehemalige Mitarbeiter und Studenten der Arbeitsgruppe

Wissenschaftliche Hilfskräfte

Maria E. Heitmeier

Studienfach:
Kognitionswissenschaft

Mitarbeit:
April bis August 2019

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Anton J. Rabe

Studienfach:
Kognitionswissenschaft

Mitarbeit:
Seit November 2018

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Christoph Blessing

Bioinformatik-Bachelor

Mitarbeit:
November 2017 bis Februar 2018

These

Development of an interactive graphical editor for systems biology models

Abschluss: September 2017

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Thomas J. Zajac

Bioinformatik-Bachelor

Mitarbeit:
Mai 2016 bis Februar 2018

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Veronika Kohler

Medieninformatik-Bachelor

Mitarbeit:
Mai bis August 2016

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Master-Studenten

Pia Rautenstrauch

Studienfach: Bioinformatik

Forschungsprojekt

Rekonstruktion von Moraxella catarrhalis BBH18

Verteidigung:
10. September 2019, 10:45 Uhr in C118a

 

Silvia Morini

Studienfach: Biologie

These

Genome-scale metabolic network reconstruction of the pathogen Treponema pallidum ssp. pallidum

Abschluss: September 2018

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Marc Alexander Voigt

Studienfach: Bioinformatik

These

Representation of ME-models in SBML

Abschluss: Juni 2018

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Bachelor-Studenten

Eike Pertuch

Studienfach: Bioinformatik

These

Modellierung und Visualisierung von spezifischen Resistenzmechanismen in Pseudomonas aeruginosa

Abschluss: September 2019

 

 

 

Niklas Henle

Studienfach: Informatik

These

Erweiterung des genomskaligen Modells von Haemophilus influenzae

Abschluss: September 2019

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Mykola Zakharchuk

Robert Deibel

Studienfach: Bioinformatik

These

Entwicklung eines Editors für großskalige biochemische Modelle

Abschluss: März 2019

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Roman Schulte

Studienfach: Informatik

These

InSilico - Concept of a Modular Research Environment
Abschluss: August 2018

Projekt im Google Summer of Code 2016

JSBML Validation System

 

Mentoren:
Jun.-Prof. Dr. Andreas Dräger, Dr. Sarah M. Keating, Dr. Michael Hucka und Nicolas Rodriguez

Mitarbeit: Mai bis August 2016

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Lisa Falk

Studienfach: Bioinformatik

These

Valiation and Simulation of Qualitative Models

Abschluss: Februar 2018

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Lea F. Buchweitz

Studienfach: Kognitionswissenschaft

These

Dynamic visualization of metabolic networks

Abschluss: September 2017

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Externe Studenten

Mehrere Softwareprodukte der Arbeitsgruppe werden wiederholt durch die Programme Google Summer of Code sowie der NRNB Academy gefördert. Dadurch können immer wieder internationale Studenten in das Team eingebunden werden, um aktiv an der Entwicklung quelloffener Software mitzuwirken.

Google Summer of Code 2019

Nikhil Ghodke

Studienfach: Technische Informatik (B.Sc.)
Affiliation: Vishwakarma Institute of Technology, Pune

Projekt

Erstellsystem für das Plugin-Framework “InSilico”
Quellcode auf GitHub

Mitarbeit: April bis September 2019

Mentoren

Roman SchulteJun.-Prof. Andreas Dräger

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Kaustubh Trivedi

Bhavye Jain

Studienfach: Informatik und Ingenieurwesen (B. Tech.)
Affiliation: Indian Institute of Technology, Roorkee

Projekt

Validierung räumlicher Modelle der Systembiologie in Java™
Quellcode auf GitHub

Mitarbeit: April bis September 2019

Mentoren

Nicolas Rodriguez, Thomas M. Hamm und Lucian P. Smith, Ph.D.

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Google Summer of Code 2018

Shalin Shah

Angestreber Abschluss: Ph.D.

Affiliation: Duke-Universität, Abteilung für Elektro- und Rechnertechnik, NC, USA

Projekt

Simulation systembiologischer Modelle in Java™

Mitarbeit: April bis August 2018

Mentoren

Jun.-Prof. Dr. Andreas Dräger und Dr. Matthias König

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Google Summer of Code 2017

Takahiro Yamada

Aktuelle Position: wissenschaftlicher Mitarbeiter

Affiliation: Keio-Universität, Institut für Biowissenschaften und Informatik

Projekt

Develop a web service which provides simulation / steady state analysis / parameter estimation with SBML models

Mitarbeit: April bis August 2017

Mentoren

Jun.-Prof. Dr. Andreas Dräger, Kaito Ii und Dr. Matthias König

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Google Summer of Code 2016

Tramy Nguyen

Position: wissenschaftliche Mitarbeiterin

Affiliation: Universität von Utah zu Salt Lake City, UT, USA

Projekt

Interconversion between the systems biology modeling formats SBML and BioPAX

Mitarbeit: Mai bis August 2016

Mentoren

Dr. Michael HuckaJun.-Prof. Dr. Andreas Dräger, Prof. Dr. Chris J. Myers,  Prof. Dr. Akira Funahashi und Nicolas Rodriguez

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Hovakim Grabski

Position: wissenschaftlicher Mitarbeiter

Affiliation: Russisch-Armenische Universität zu Jerewan, Armenien

Projekt

Java support for Deviser, a code generation system for SBML libraries

Mitarbeit: May bis August 2016

Mentoren

Dr. Frank T. Bergmann, Dr. Sarah M. KeatingJun.-Prof. Dr. Andreas Dräger und Nicolas Rodriguez

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Kaito Ii

Position: wissenschaftlicher Mitarbeiter

Affiliation: Keio-Universität, Institut für Bioswissenschaften und Informatiks, Japan

Projekt

Interconvertible Layout software for CellDesigner

Mitarbeit: Mai bis August 2016

Mentoren

Prof. Dr. Akira Funahashi, Jun.-Prof. Dr. Andreas Dräger, Nicolas Rodriguez und Dr. Michael Hucka

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Devesh Khandelwal

Studienfach: Informationstechnologie und Mathematik

Affiliation: Universität Delhi, Delhi, Indien

Projekt

Visual Biology with Escher

Mitarbeit: Mai bis August 2016

Mentoren

Zachary A. King und Jun.-Prof. Dr. Andreas Dräger

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