Aktuelles

16.11.2021

Neue genom-skalige Rekonstruktion von Corynebacterium simulans PES1

In seiner Bachelorarbeit rekonstruierte Jan-Philipp Leusch ein neues Modell.

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26.10.2021

ILW-Förderpreis 2020/21 geht an Nantia Leonidou für ihre Masterarbeit

Nantia Leonidou für ihre Masterarbeit über gewebsspezifische Rekonstruktion restriktionsbasierter…

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15.09.2021

Erfolgreiche Disputation in Rechnerbasierten Neurowissenschaften

Martina Feierabend verteidigt erfolgreich ihre Doktorabeit „Plasticity of the auditory modality”.

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30.07.2021

Mitgestaltung der 6. jährlichen SysMod-Tagung der ISMB/ECCB

Erneut gestaltet das Systembiologie-Team die internationale Fachtagung zur System-Modellierung mit.

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18.05.2021

Automatisierte Erweiterung des Modells zu C. striatum

Famke Bäuerle hat eine Vorlage für Rekonstruktionen implementiert und auf C. striatum als…

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03.03.2021

Proteinsequenz-Clustering mit DIAMOND

In ihrer Bachelorarbeit erweiterte und optimierte Jasmin Katz den Clustering-Algorithmus von…

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26.02.2021

Schülerinnen modellieren multiresistente Bakterien für Jugend forscht

Aleyna Murat und Burcu Karakum erreichen mit systembiologischen Modellen den 3. Platz.

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26.01.2021

Gewebsspezifische Rekonstruktion restriktionsbasierter metabolischer Modelle basierend auf ReconX

In ihrer Masterarbeit implementierte Nantia Leonidou ein Tool zur gewebespezifischen…

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21.10.2020

Genomskaliges Modell von Corynebacterium glutamicum

In ihrer Masterarbeit erstellte Martina Feierabend ein erweitertes Modell eines der wichtigsten…

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07.10.2020

Automatische Zuordnung von Termini der Systembiologischen Ontologie

In ihrer Bachelorarbeit schlägt Elisabeth Fritze einen Ansatz zur automatischen Zuweisung von…

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15.09.2020

Visuelle explorative Web-Anwendung für Flussstichprobenergebnisse

In seiner Masterarbeit erstellte Constantin Holzapfel eine visuelle explorative Webanwendung zur…

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09.09.2020

Alina Renz für ihre Masterarbeit über die Virulenzfaktoren von P. aeruginosa ausgezeichnet

Die Deutsche Gesellschaft für medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie zeichnet Alina…

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01.07.2020

Diagrammerstellung gegen COVID-19

Wir kämpfen gegen SARS-CoV-2 in großen Teams und mit Unterstützung von yWorks.

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16.06.2020

Genomskaliges Modell von Staphylococcus epidermidis

In ihrer Bachelorarbeit erstellte Anastasiia Grekova ein erstes Modell des fakultativen Pathogens…

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02.06.2020

Erster Modellentwurf für Corynebacterium striatum KC-Na-01

Im Rahmen ihres Forschungsprojektes konstruierte Tanja Urz ein neues Computer-Modell.

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02.06.2020

Visualisierung klinischer Multiomikdaten – Die webbasierte Anwendung VMOD wird erweitert

Verbesserung der webbasierten Visualisierungssoftware VMOD in Ebru Cobanoglus Bachelorarbeit

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05.05.2020

Tabellarischer Editor für systembiologische Modelle

Marietta Hamberger entwickelte einen Tabelleneditor für das SBTab-Format als InSilico-Plugin.

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05.05.2020

Automatische Verknüpfung vom Genom zum Reaktom

Manuel Dienerts Ansatz zur automatischen Herleitung von Gen-Protein-Reaktions-Regeln

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04.05.2020

Google fördert Studenten-Projekte

Zwei internationale Studenten erweitern Software der Arbeitsgruppe Systembiologie.

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29.04.2020

Potentielles Wirkstoffziel gegen SARS-CoV-2

Wie das Ausschalten eines Enzyms das Virus stoppen könnte.

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16.03.2020

Erster Modellentwurf für Dolosigranulum pigrum 83VPs KB5

In ihrem Forschungsprojekt konstruierte Lina Widerspick ein neues Model.

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19.11.2019

Webbasierte Visualisierung klinischer Multiomikdaten in Netzwerken

Eine neue Browser-Software setz klinische Daten in den Kontext biologischer Netzwerke.

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24.09.2019

Antibiotika-Resistenz in Pseudomonas aeruginosa

In seiner Bachelorarbeit untersuchte Eike Pertuch relevante Resistenzmechanismen.

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10.09.2019

Erster Modell-Entwurf zu Moraxella catarrhalis BBH18

Als Ergebnis ihres Forschungsprojektes legt Pia Rautenstrauch ein neues Modell vor.

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10.09.2019

Aktualisiertes Modell des Erregers H. influenzae

Niklas Henle erweiterte in seiner Bachelorarbeit ein genomskaliertes Modell von Haemophilus…

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03.09.2019

Google verkündet Ergebnisse des Summers of Code 2019

Alle drei Systembiologie-Projekte schlossen erfolgreich beim Summer of Code ab.

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29.08.2019

Dynamische animierte metabolishe Netzwerke

SBMLsimulator 2.0 ermöglicht Nutzern, zeitlich aufgelöste Datensätze auf interaktive Netzwerke…

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17.06.2019

Interaktiver visueller Simulator für systembiologische Modelle

Mykola Zakharchuk entwickelte in seiner Bachelorarbeit ein interaktives InSilico-Plugin.

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06.05.2019

Google fördert drei Studenten-Projekte

Drei internationale Studenten erweitern Software-Projekte der Arbeitsgruppe für Systembiologie im…

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11.03.2019

4. Jahrestagung zu biologischer Systemmodellierung

Im Rahmen der ISMB/ECCB können bis zum 11. April Beiträge zu SysMod eingereicht werden.

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02.03.2019

Erste Version einer InSilico-App für SBML-Dateien

Robert Deibel erstellte ein tabellen-basierendes Editor-Plugin für InSilco.

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26.02.2019

Google Summer of Code 2019

Internationale Student(inn)en können sich ab sofort für spannende Projete bewerben.

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08.02.2019

Interfakultäres Institut für Biomedizinische Informatik wird eingerichtet

Initiative stärkt die digitalen Lebenswissenschaften

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19.12.2018

Gendeletion erhöht die bakterielle Virulenz

Gene des zentralen Kohlenstoffwechsels beeinflussen Virulenz des Krankenhauskeims P. aeruginosa.

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30.10.2018

Erster Modell-Entwurf des Syphilis-Erregers

In ihrer Masterarbeit rekonstruierte Silvia Morini das erste genomskalige Modell für Treponema…

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27.09.2018

Exzellenzcluster zur Bekämpfung von Infektionskrankheiten

Die Universität Tübingen konnte 3 Exzellenzcluster eingwerben; eines mit Systembiologie-Beteiligung.

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24.09.2018

Visualisierung biochemischer Prozesse - Temperaturabähngigkeit in roten Blutkörperchen

Animation erklärt Temperaturabhängigkeit des Stoffwechsels in menschlichen Erythrozyten.

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20.09.2018

Visualisierung biochemischer Prozesse - Lagerung von Blutplättchen

Eine Animation erklärt biochemische Vorgänge in Blutkonserven durch eine neuartige Visualisierung.

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23.08.2018

Neues Plugin-basiertes Software-Framework

Gratulation an Roman Schulte für die erfolgreiche Verteidigung seiner Bachelor-These.

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22.08.2018

Google Summer of Code 2018 (GSoC)

Shalin Shah von der Duke-Universität hat diesen Sommer erfolgreich am SBSCL-Projekt gearbeitet.

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02.07.2018

Neu berufen: Juniorprofessor Dr. Andreas Dräger

Juniorprofessur für Computational Systems Biology of Infection and Antimicrobial-Resistant Pathogens…

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26.06.2018

Modellierung von Metabolismus- und Genexpression in SBML

Ersten Entwurf für einen einheitlichen Standards zum Speichern von ME-Modellen in SBML entwickelt.

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17.05.2018

Validierung und Simulation of qualitativer Modelle in Java™

Die Java-Bibliothek JSBML wurde um ein Paket für logische Modellierung erweitert.

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20.02.2018

Die Stoffwechsel-Modellierung wird dreidimensional

Forscherkonsortium entwickelt Computermodellierung Recon3D weiter

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28.09.2017

Dynamische Visualisierung zeitabhängiger Daten im Kontext systembiologischer Netzwerke

In zwei Bachelorarbeiten wurden Methoden zur Animation biologischer Netzwerke anhand von…

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31.08.2017

Modellierung der essentiellen Gene des mikrobiellen Lebens

EU-Projekt leistet Beitrag, um lebensnotwendigen genetischen Kern von Zellen zu identifizieren.

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11.09.2016

YouTube-Kanal zu Systembiologie

Ein neuer Kanal mit Themen rund um die Systembiologie wurde auf YouTube eingerichtet.

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11.08.2015

Minimalausstattung für den Mikroorganismus

Bioingenieure identifizieren die Schlüsselgene und -funktionen für das Überleben von Bakterienzellen…

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10.08.2015

Bioingenieure identifizieren Schlüsselgene mikrobiellen Lebens

Neue Studie definiert die minimale genetische Zusammensetzung und Funktionen bakterieller Zellen

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