30.07.2021

Mitgestaltung der 6. jährlichen SysMod-Tagung der ISMB/ECCB

Erneut gestaltet das Systembiologie-Team die internationale Fachtagung zur System-Modellierung mit.

Die jährliche ISMB-Konferenz („Intelligent Machines for Molecular Biology”) fand auch 2021 wieder unter Coronabedingungen als virtuelle Veranstaltung in Kombination mit der Europäischen Bioinformatik-Konferenz (ECCB) statt. Seit der Gründung der dazugehörigen Fachtagung für Systemmodellierung (SysMod) im Jahr 2016 trägt die Tübinger Arbeitsgruppe für Systembiologie maßgeblich zur Organisation und Gestaltung dieser Veranstaltung bei.

Mitglieder der Arbeitsgruppe hielten zwei Vorträge:

• Dr. Reihaneh Mostolizadeh: „Workflow for modeling microbial community interactions applied to Dolosigranulum pigrum and Staphylococcus aureus within the human nose”
• Nantia Leonidou: „Tissue-specific reconstruction of constraint-based metabolic models based on ReconX”

und in die Vorbereitung zweier weiterer war die Arbeitsgruppe eingebunden:

• Dawson D. Payne: „An updated genome-scale metabolic network reconstruction of Pseudomonas aeruginosa PA14 to characterize mucin-driven shifts in bacterial metabolism”
• Sanjeev Dahal: „Genome-scale modeling of Pseudomonas aeruginosa PA14 unveils its broad metabolic capabilities and role of metabolism in virulence and drug potentiation”

Jun.-Prof. Dr. Andreas Dräger leitete die Sitzung zum Thema „Infectious disease modeling”.

Zusätzlich präsentierte die Tübinger Arbeitsgruppe weitere Ergebnisse in Form dreier wissenschaftlicher Plakate:

• Martina Feierabend: „High-quality genome-scale reconstruction of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032”
• Alina Renz: „Curating and Comparing 114 Strain-Specific Genome-Scale Metabolic Models of Staphylococcus aureus”
• Jun.-Prof. Dr. Andreas Dräger: „The Systems Biology Simulation Core Library”

Die nächste Veranstaltung zu SysMod soll im Jahr 2022 wieder als Konferenz mit Präsenzvorträgen stattfinden, wenn dies die Gegebenheiten zulassen.