06.03.2024

Rekonstruktion eines Stoffwechselmodells für Staphylococcus warneri AW25

Sophia Krappen erstellt in ihrer Bachelorarbeit das erste genom-skalige Modell zum AW25 Stamm von S. warneri.

S. warneri gehört zur Gattung Staphylococcus und ist weit verbreitet auf der menschlichen Haut und den Schleimhäuten. Das Bakterium agiert sowohl als kommensaler Organismus als auch als potenzielle Infektionsquelle. Infektionen werden vorrangig bei immungeschwächten Personen und Neugeborenen beobachtet. Um neue Behandlungsmethoden zu erforschen und den Stoffwechsel des Bakteriums besser zu verstehen, wurde in dieser Bachelorarbeit ein Modell zum AW25 Stamm von S. warneri erstellt. Die Validierung des Modells umfasste die Identifizierung wesentlicher Gene, die Aufschluss über Schwachstellen und potenzielle Angriffspunkte für Medikamente geben. Das Wachstum des Bakteriums hat Sophia Krappen in silico auf verschiedenen Medien wie zum Beispiel dem synthetischen Nasenmedium SNM3 untersucht. Eine vergleichende Analyse mit dem Staphylococcus aureus Modell iYS854 hebt gemeinsame und einzigartige Stoffwechselmerkmale hervor. Das erstellte Modell kann als Ausgangspunkt dienen, um S. warneri und sein Zusammenspiel mit anderen Organismen weiter zu erforschen.