02.06.2020

Visualisierung klinischer Multiomikdaten – Die webbasierte Anwendung VMOD wird erweitert

Verbesserung der webbasierten Visualisierungssoftware VMOD in Ebru Cobanoglus Bachelorarbeit

Visualization of Multiomics Data, kurz VMOD, ist eine visuelle webbasierte Analyseanwendung. Diese ermöglicht, auf Basis eines Transkriptomik-Datensatzes, verschiedene Netzwerke biologischer Pfade zu erkunden. Alle Daten werden ausschließlich lokal verarbeitet und zudem ist keine zusätzliche Software zu installieren.

Aufbauend auf der Arbeit von Manuel Harke (2019) wurden in der Bachelorarbeit von Ebru Cobanoglu weitere Funktionen ergänzt. Erweitert wurde VMOD durch die Möglichkeit einzelne Stoffwechselwege mit einer von KEGG bekannten Anordnung erkunden zu können. Zudem werden zusätzliche Informationen aus der KEGG-Datenbank graphisch dargestellt und verlinkt.