20.09.2022

Rekonstruktion eines genom-skaligen metabolischen Netzwerks von Staphylococcus lugdunensis

Selin Sahin erstellt im Rahmen ihrer Bachelorarbeit das erste genom-skalige metabolische Modell für Staphylococcus lugdunensis N920143

Staphylococcus lugdunensis ist ein grampositiver und koagulasenegativer menschlicher Kommensale. Das Bakterium kann ein Polypeptidantibiotikum namens Lugdunin produzieren. Lugdunin wirkt gegen verschiedene Krankheitserreger, insbesondere Staphylococcus aureus, welches bekanntermaßen schwere Infektionen beim Menschen verursachen kann. Die nasale Kolonisierung durch S. lugdunensis wurde mit einer signifikant reduzierten S. aureus Rate in Verbindung gebracht. Deswegen wird die Verwendung von S. lugdunensis als ein Probiotikum zur Bekämpfung von S. aureus bei betroffenen Patienten untersucht. Dieses Vorhaben wird jedoch dadurch erschwert, dass S. lugdunensis ein opportunistischer Erreger mit hoher Virulenz ist. Obwohl Teil der normalen Hautflora ist, wurde festgestellt, dass es ähnlich wie S. aureus Infektionen verursachen kann. Mit dem Ziel, ein besseres Verständnis für den Stoffwechsel dieses einzigartigen und vielfältigen Bakteriums zu gewinnen, erstellte Frau Selin Sahin in ihrer Bachelorarbeit das genom-skalige metabolische Modell, iSLN22SS. Dieses Modell wurde mittels verschiedener Computerprogramme und Skripten erstellt, optimiert und schließlich durch experimentelle Daten validiert.