Eine große Zahl verschiedenster archäozoologischer Projekten befinden sich derzeit an der Universität Tübingen in Arbeit. Diese Projekte reichen vom Altpaläolithikum bis in die heutige Zeit und umspannen einen großen geografischen Bereich, von Eurasien bis Afrika. Größere Forschungsbereiche sind:
| Achalm (Urnenfeld) |
| Die Höhlenbären des Hohle Fels |
| Geißenklösterle (Mittleres und Jungpaläolithikum) |
| Fetzershaldenhöhle (Paläo- und Neolithikum) |
| Vogelherd (Mittleres und Jungpaläolithikum) |
| Hohlenstein-Stadel (Mittleres und Jungpaläolithikum) |
| Helga Abri (Mesolithikum) |
| Zigeunerfels (Jungpaläolithikum und Mesolithikum) |
| Schöningen (Ausgang Altpaläolithikum) |
| Salzgitter-Lebenstedt (Mittelpaläolithikum) |
| Kephalari Cave (Ende Mittelpaläolithikum bis Mesolithikum) |
| Klissoura Cave 1 (Mittelpaläolithikum bis Mesolithikum |
| Lakonis 1 (Mittelpaläolithikum) |
| Mount Lykaion (Bronzezeit bis Hellenismus) |
| Chogha Golan (Iran; Präkeramisches Neolithikum) |
| Ulucak Höyük (İzmir, Türkei; Bronzezeit) |
| Troja (Türkei) |
| Tübingen-Damascus Archaeological Survey Project (Syrien) |
| Mumba Rockshelter (Tansania) |
| Sibudu Cave (Südafrika; Mittlere Steinzeit) |
| Hoedjiespunt (Südafrika; Mittlere Steinzeit) |
| Viehhaltung und Jagd in Troia | |
| Die Großsäugerfauna des Geißenklösterle |
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