29.04.2024

Algorithmus zum Aufspüren und Lösen energiegenerierender Zyklen

Am Beispiel des Stoffwechsels von S. sanguinis entwickelte Tobias Fehrenbach in seiner Masterarbeit…

06.03.2024

Rekonstruktion eines Stoffwechselmodells für Staphylococcus warneri AW25

Sophia Krappen erstellt in ihrer Bachelorarbeit das erste genom-skalige Modell zum AW25 Stamm von S.…

26.07.2023

SPECIMEN: Ein Verfahren zur automatisierten stammspezifischen Modellierung des Stoffwechsels

Carolin Brune entwickelt in ihrer Masterarbeit eine Modellierungssoftware und wendet diese auf…

23.05.2023

Rekonstruktion, Validierung und phänotypischen Vorhersagen stammspezifisches Stoffwechselmodells von Staphylococcus capitis.

Anna Lefarova erstellt in ihrer Bachelorarbeit ein metabolisches Modell für S. capitis.

17.05.2023

Stammspezifische Stoffwechselmodelle von Corynebacterium striatum

Famke Bäuerle rekonstruiert Stoffwechselmodelle und validiert diese in vitro im Rahmen zweier…

16.05.2023

Rekonstruktion, Vergleich und Wachstumssimulation stammspezifischer Stoffwechselmodelle von Staphylococcus haemolyticus

Gwendolyn O. Gusak entwickelt in ihrer Masterarbeit eine Sammlung hochwertiger Modelle für S.…

24.03.2023

Erfolgreich Disputation unseres füheren Gruppenmitglieds

Thorsten Tiede verteidigte erfolgreich seine Dissertation „Biologische Netzwerke für molekulare…

23.03.2023

Computermodellierung zur schnelleren Entwicklung antiviraler Medikamente

Vorbereitung auf die nächste Pandemie: Tübinger Forschende suchen im Computermodell nach…

03.03.2023

3. Platz beim Jugend-Forscht-Wettbewerb

Unsere Nagolder Schüler Henrik Schick und Simon Straub konnten mit ihrem Virus-Modell überzeugen

20.09.2022

Rekonstruktion eines genom-skaligen metabolischen Netzwerks von Staphylococcus lugdunensis

Selin Sahin erstellt im Rahmen ihrer Bachelorarbeit das erste genom-skalige metabolische Modell für…

22.08.2022

Erste genom-skalige Rekonstruktion von Klebsiella penumoniae HS11286

Meike Lips erstellt in ihrer Bachelorarbeit das erste Modell zum HS11286-Stamm von K. pneumoniae.

22.08.2022

Genomskaliges Stoffwechselmodell zu Acinetobacter baumannii

Yufan Xia erstellte und validierte ein Modell des Stammes ATCC 17978 unter Berücksichtigung früherer…

14.06.2022

Erstes Stoffwechselmodell zu Proteus vulgaris FDAARGOS_1507 (DSM 46228)

Manuel Harke rekonstruiert im Rahmen der Masterarbeit das erste genomweite Stoffwechselmodell von…

13.05.2022

Erste Disputation unserer Gruppe erfolgreich abgeschlossen

Alina Renz verteidigt erfolgreich ihre Doktorarbeit „From Nose to Lung: Using Systems Biology to…

24.03.2022

Neues Computermodell von Finegoldia magna ATCC 29328

Ein neues genomisches Stoffwechselmodell von Finegoldia magna wurde von Josua Carl im Rahmen einer…

16.11.2021

Neue genom-skalige Rekonstruktion von Corynebacterium simulans PES1

In seiner Bachelorarbeit rekonstruierte Jan-Philipp Leusch ein neues Modell.

26.10.2021

ILW-Förderpreis 2020/21 geht an Nantia Leonidou für ihre Masterarbeit

Nantia Leonidou für ihre Masterarbeit über gewebsspezifische Rekonstruktion restriktionsbasierter…

15.09.2021

Erfolgreiche Disputation in Rechnerbasierten Neurowissenschaften

Martina Feierabend verteidigt erfolgreich ihre Doktorabeit „Plasticity of the auditory modality”.

30.07.2021

Mitgestaltung der 6. jährlichen SysMod-Tagung der ISMB/ECCB

Erneut gestaltet das Systembiologie-Team die internationale Fachtagung zur System-Modellierung mit.

05.07.2021

Schwachstellen im Virus anhand von Computermodellen aufspüren

Andreas Dräger trägt zur Wissenschaftskommunikation bei - hier mit einem Podcast in der Apotheken…

18.05.2021

Automatisierte Erweiterung des Modells zu C. striatum

Famke Bäuerle hat eine Vorlage für Rekonstruktionen implementiert und auf C. striatum als…

03.03.2021

Proteinsequenz-Clustering mit DIAMOND

In ihrer Bachelorarbeit erweiterte und optimierte Jasmin Katz den Clustering-Algorithmus von…

26.02.2021

Schülerinnen modellieren multiresistente Bakterien für Jugend forscht

Aleyna Murat und Burcu Karakum erreichen mit systembiologischen Modellen den 3. Platz.

26.01.2021

Gewebsspezifische Rekonstruktion restriktionsbasierter metabolischer Modelle basierend auf ReconX

In ihrer Masterarbeit implementierte Nantia Leonidou ein Tool zur gewebespezifischen…

14.01.2021

Potentieller Therapieansatz gegen COVID-19 dank Bioinformatik

Großes Medienecho auf Forschungsergebnisse zu SARS-CoV-2 von Jun.-Prof. Andreas Dräger und Alina…

21.10.2020

Genomskaliges Modell von Corynebacterium glutamicum

In ihrer Masterarbeit erstellte Martina Feierabend ein erweitertes Modell eines der wichtigsten…

07.10.2020

Automatische Zuordnung von Termini der Systembiologischen Ontologie

In ihrer Bachelorarbeit schlägt Elisabeth Fritze einen Ansatz zur automatischen Zuweisung von…

15.09.2020

Visuelle explorative Web-Anwendung für Flussstichprobenergebnisse

In seiner Masterarbeit erstellte Constantin Holzapfel eine visuelle explorative Webanwendung zur…

09.09.2020

Alina Renz für ihre Masterarbeit über die Virulenzfaktoren von P. aeruginosa ausgezeichnet

Die Deutsche Gesellschaft für medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie zeichnet Alina…

01.07.2020

Diagrammerstellung gegen COVID-19

Wir kämpfen gegen SARS-CoV-2 in großen Teams und mit Unterstützung von yWorks.

16.06.2020

Genomskaliges Modell von Staphylococcus epidermidis

In ihrer Bachelorarbeit erstellte Anastasiia Grekova ein erstes Modell des fakultativen Pathogens…

02.06.2020

Erster Modellentwurf für Corynebacterium striatum KC-Na-01

Im Rahmen ihres Forschungsprojektes konstruierte Tanja Urz ein neues Computer-Modell.

02.06.2020

Visualisierung klinischer Multiomikdaten – Die webbasierte Anwendung VMOD wird erweitert

Verbesserung der webbasierten Visualisierungssoftware VMOD in Ebru Cobanoglus Bachelorarbeit

05.05.2020

Tabellarischer Editor für systembiologische Modelle

Marietta Hamberger entwickelte einen Tabelleneditor für das SBTab-Format als InSilico-Plugin.

05.05.2020

Automatische Verknüpfung vom Genom zum Reaktom

Manuel Dienerts Ansatz zur automatischen Herleitung von Gen-Protein-Reaktions-Regeln

04.05.2020

Google fördert Studenten-Projekte

Zwei internationale Studenten erweitern Software der Arbeitsgruppe Systembiologie.

29.04.2020

Potentielles Wirkstoffziel gegen SARS-CoV-2

Wie das Ausschalten eines Enzyms das Virus stoppen könnte.

16.03.2020

Erster Modellentwurf für Dolosigranulum pigrum 83VPs KB5

In ihrem Forschungsprojekt konstruierte Lina Widerspick ein neues Model.

09.03.2020

Neues Software-Tool fördert die Qualitätskontrolle virtueller Stoffwechselmodelle

19.11.2019

Webbasierte Visualisierung klinischer Multiomikdaten in Netzwerken

Eine neue Browser-Software setz klinische Daten in den Kontext biologischer Netzwerke.

24.09.2019

Antibiotika-Resistenz in Pseudomonas aeruginosa

In seiner Bachelorarbeit untersuchte Eike Pertuch relevante Resistenzmechanismen.

10.09.2019

Erster Modell-Entwurf zu Moraxella catarrhalis BBH18

Als Ergebnis ihres Forschungsprojektes legt Pia Rautenstrauch ein neues Modell vor.

10.09.2019

Aktualisiertes Modell des Erregers H. influenzae

Niklas Henle erweiterte in seiner Bachelorarbeit ein genomskaliertes Modell von Haemophilus…

03.09.2019

Google verkündet Ergebnisse des Summers of Code 2019

Alle drei Systembiologie-Projekte schlossen erfolgreich beim Summer of Code ab.

29.08.2019

Dynamische animierte metabolishe Netzwerke

SBMLsimulator 2.0 ermöglicht Nutzern, zeitlich aufgelöste Datensätze auf interaktive Netzwerke…

17.06.2019

Interaktiver visueller Simulator für systembiologische Modelle

Mykola Zakharchuk entwickelte in seiner Bachelorarbeit ein interaktives InSilico-Plugin.

06.05.2019

Google fördert drei Studenten-Projekte

Drei internationale Studenten erweitern Software-Projekte der Arbeitsgruppe für Systembiologie im…

11.03.2019

4. Jahrestagung zu biologischer Systemmodellierung

Im Rahmen der ISMB/ECCB können bis zum 11. April Beiträge zu SysMod eingereicht werden.

02.03.2019

Erste Version einer InSilico-App für SBML-Dateien

Robert Deibel erstellte ein tabellen-basierendes Editor-Plugin für InSilco.

26.02.2019

Google Summer of Code 2019

Internationale Student(inn)en können sich ab sofort für spannende Projete bewerben.

08.02.2019

Interfakultäres Institut für Biomedizinische Informatik wird eingerichtet

Initiative stärkt die digitalen Lebenswissenschaften

19.12.2018

Gendeletion erhöht die bakterielle Virulenz

Gene des zentralen Kohlenstoffwechsels beeinflussen Virulenz des Krankenhauskeims P. aeruginosa.

30.10.2018

Erster Modell-Entwurf des Syphilis-Erregers

In ihrer Masterarbeit rekonstruierte Silvia Morini das erste genomskalige Modell für Treponema…

27.09.2018

Exzellenzcluster zur Bekämpfung von Infektionskrankheiten

Die Universität Tübingen konnte 3 Exzellenzcluster eingwerben; eines mit Systembiologie-Beteiligung.

24.09.2018

Visualisierung biochemischer Prozesse - Temperaturabähngigkeit in roten Blutkörperchen

Animation erklärt Temperaturabhängigkeit des Stoffwechsels in menschlichen Erythrozyten.

20.09.2018

Visualisierung biochemischer Prozesse - Lagerung von Blutplättchen

Eine Animation erklärt biochemische Vorgänge in Blutkonserven durch eine neuartige Visualisierung.

23.08.2018

Neues Plugin-basiertes Software-Framework

Gratulation an Roman Schulte für die erfolgreiche Verteidigung seiner Bachelor-These.

22.08.2018

Google Summer of Code 2018 (GSoC)

Shalin Shah von der Duke-Universität hat diesen Sommer erfolgreich am SBSCL-Projekt gearbeitet.

02.07.2018

Neu berufen: Juniorprofessor Dr. Andreas Dräger

Juniorprofessur für Computational Systems Biology of Infection and Antimicrobial-Resistant Pathogens…

26.06.2018

Modellierung von Metabolismus- und Genexpression in SBML

Ersten Entwurf für einen einheitlichen Standards zum Speichern von ME-Modellen in SBML entwickelt.

17.05.2018

Validierung und Simulation of qualitativer Modelle in Java™

Die Java-Bibliothek JSBML wurde um ein Paket für logische Modellierung erweitert.

20.02.2018

Die Stoffwechsel-Modellierung wird dreidimensional

Forscherkonsortium entwickelt Computermodellierung Recon3D weiter

28.09.2017

Dynamische Visualisierung zeitabhängiger Daten im Kontext systembiologischer Netzwerke

In zwei Bachelorarbeiten wurden Methoden zur Animation biologischer Netzwerke anhand von…

31.08.2017

Modellierung der essentiellen Gene des mikrobiellen Lebens

EU-Projekt leistet Beitrag, um lebensnotwendigen genetischen Kern von Zellen zu identifizieren.

11.09.2016

YouTube-Kanal zu Systembiologie

Ein neuer Kanal mit Themen rund um die Systembiologie wurde auf YouTube eingerichtet.

11.08.2015

Minimalausstattung für den Mikroorganismus

Bioingenieure identifizieren die Schlüsselgene und -funktionen für das Überleben von Bakterienzellen…

10.08.2015

Bioingenieure identifizieren Schlüsselgene mikrobiellen Lebens

Neue Studie definiert die minimale genetische Zusammensetzung und Funktionen bakterieller Zellen