Zertifikate sind ein Zeichen für eine zusätzliche fächerübergreifende Qualifikation. Die Graduiertenakademie bietet aktuell das Zertifikatsprogramm "Leadership in Wissenschaft, Wirtschaft & Gesellschaft" für promovierte WissenschaftlerInnen an, und die Zertifikatsprogramme “Wissenschaft Transfer und Schule”, "Wissenschaftskommunikation und mediale Kompetenz" und "Wissenschaftsmanagement" für promovierende und promovierte WissenschaftlerInnen.
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