Im Bereich der Forschung gibt es mehrere Kommissionen, in denen fachbereichsspezifische Expertise sowie das Know-How außeruniversitärer Kooperationspartner gebündelt werden.  Diese Kommissionen beraten die Hochschulleitung und sprechen Empfehlungen im Rahmen interner Begutachtungsprozesse aus.

• Strategiekommission Forschung
• Kommission für Forschungsfragen
• Kommission Core Facilities
• Kommission zur Untersuchung von Fehlverhalten in der Wissenschaft

An der Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät berät die Forschungskommission z. B. zur Vorbereitung neuer Verbundprojekte.